第三与章2 转录的延伸、终止以及RNA的加工.pptVIP

一、转录的延伸 RNA链延伸的基本过程 RNA链延伸的暂停 RNA链延伸的再次启动; RNA链延伸的基本过程;RNA链的延长，不是以恒定速度进行的; RNA链延伸的暂停 链延伸的速度不是恒定的，在DNA的某些区域，转录速度减慢或停止，常发生在富含GC区。;A stalled RNA polymerase can be released by cleaving the 3 end of the transcript. ;1、转录终止概述;2、大肠杆菌的两类终止子 ;终止子结构; 终止需要的DNA序列位于终止位点序列之前； RNA发夹结构的形成可能是必要的。; 依赖ρ因子的终止 ;Rho has an N-terminal RNA-binding domain and a C-terminal ATPase domain. A hexamer in the form of a gapped ring binds RNA along the exterior of the N-terminal domains. ;依赖ρ因子的终止子GC含量低，使延宕时间变短； 回文序列下游缺乏连续的A/U;RNA Pol转录DNA;三、真核生物RNA转录的终止;(2) RNA聚合酶Ⅱ终止位点的专一性可能不强，终止一般发生在产生成熟mRNA（专一序列切割处）3′端下游1000 bp 以外的位点上。终止位点二级结构的形成可能比具体的碱基序列更重要，可能需要一段富含AT的序列。;(3) RNA聚合酶Ⅲ转录在RNA末端处终止。RNA末端富含GC序列中的寡聚T（4个以上）是终止信号，RNA聚合酶Ⅲ在此处终止转录。 除聚合酶Ⅲ本身外，似乎不需要其它蛋白质因子参与转录的终止。;四、抗终止;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;2.依赖于蛋白质因子的转录抗终止;Antitermination extends the transcription unit;五、原核生物与真核生物mRNA的特征比较; 1、转录发生的部位;原核生物mRNA (1) 许多是以多顺反子形式存在； (2) 5′端无帽子结构； (3) 3′端没有或只有较短的poly(A)。起始密码AUG上游7-12个核苷酸处有一被称为SD (Shine-Dalgarno sequence)的保守区，与16S rRNA 3′端保守核苷酸反向互补。 rRNA保守区：3′-UCCUCC-5′;真核生物mRNA结构特征 ; 5′ Gppp+pppApNpNp … 5′GpppApNpNp…+PP+P ;帽子覆盖了mRNA的5′端，它可在几个位点被甲基化;mRNA 5′末端帽子特征的生物学功能：; 高等真核??物（除组蛋白基因）的mRNA， 3′端具有poly(A)尾巴，长度40－200 bp。;AAUAAA;生物学功能： I: 保持mRNA的稳定性，防止被降解； II: 与翻译起始有关。;应用一：★Poly(A)用来从总RNA中分离mRNA; 可设计寡聚Oligo (dT)片段合成cDNA;(4) 真核生物mRNA中常含有内含子;3. 生命周期;六、转录后加工;（一）tRNA的加工 （二）rRNA的加工 （三）mRNA的加工 ;（一）tRNA的加工;tRNA加工时需要多种核酸酶参与： 如：RNase D、E、F和P等，RNaseP主要在tRNA的5′起作用。它由蛋白质和RNA组成，它不识别特殊序列，只识别二级结构。 RNaseD主要负责切除3′序列。 tRNA核苷酸转移酶，催化3′末端的CCA的生成。;（1）识别发夹结构的内切核酸酶切断RNA链； （2）RNAaseD识别CCA末端序列，一个一个除去七个核苷酸。 （3）内切核酸酶P切断RNA，形成5′末端； (4) RNAaseD除去3′末端的二个核苷酸，形成3′-OH末端。; 缺-CCA的tRNA要用tRNA核酸转移酶加-CCA。 (5) 修饰：通过甲基化酶，硫醇酶，假 尿嘧啶核苷化酶等进行修饰，如氨 基酸臂的4-硫尿苷，D臂的2甲基鸟苷，TψC臂的假尿 苷