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第二节 噬菌体载体 2012.09 一、?噬菌体载体 λ噬菌体感染细菌后的溶菌性生长和溶源性生长 溶菌性生长(lytic pathway) 噬菌体感染细菌后,借助其2个COS位点互补成环,在宿主菌体内连续复制,合成大量基因产物,进而装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌,释放出来的噬菌体又可感染其他细菌。 溶源性生长(lysogenic pathway) 噬菌体感染细菌后,可将自身DNA整合到细菌的染色体中去,与之一起复制,并遗传给子代细胞,宿主细胞不被裂解 。 ?噬菌体 ◆ λ噬菌体载体可接受15 kb-23 kb的外源DNA片段,它既可作为克隆载体,也可作为表达载体,广泛用于各类基因库的构建。 二、单链噬菌体载体 3. M13噬菌体 (一)粘粒(cosmid) 3 PCR产物克隆载体 T 载体 pCR系列载体 Invitrogen公司开发的线性噬菌粒载体。 ① 结构 pUC的质粒部分、fi噬菌体ori、Kanr和Ampr抗性。 MCS的中部已经切开,各有一个3’端突出的T。 ② 特点 PCR产物往往在3’端突出一个A,所以能与这个载体直接连接。 T vector的克隆过程——简便! A A T T T vector PCR product T4 DNA ligase A A 四、柯斯质粒载体 (五)λ-DNA作为载体的优点 体外包装病毒颗粒,高效感染E.coli 2) 装载外源能力为25kb,大于质粒 3) 筛选方便 4) 重组λ-DNA分子提取容易 (一)单链噬菌体载体 M13、f1、fd 噬菌体 单链环状DNA的丝状大肠杆菌噬菌体: M13 噬菌体 单链DNA噬菌体载体 M13、f1、fd。 优越性: 1. 单链DNA噬菌体的复制,是以双链环形的DNA为媒介的,这种复制形式 的 DNA简称RFDNA; 2. 不论是RFDNA还是ssDNA都能感染大肠杆菌; 3. 单链DNA噬菌体颗粒的大小,是受其DNA的多制约的,不存在包装限制 问题; 4. 容易测定外源DNA片断的插入取向; 5. 可产生含外源片断的单链DNA分子。 噬菌体 正链 复制 复制型 DNA 经pII蛋白 造缺口 3′ 5′ 经pII 蛋白 剪切 释出单链DNA(正链) 进入下 一循环 5′ 3′ 3′ 5′ 滚环复制 在细菌内的复制模式图 M13噬菌体几个重要特点: 1. M13噬菌体不溶解宿主细胞,只是降 低宿主细胞的生长速度。 2. M13噬菌体能以单链和双链两种方式存在,因此可以用感染(经包装的单链DNA)和转化(双链DNA)。 3. 克隆的外源基因片段不宜大于1000bp。 M13噬菌体载体 M13是一种含单键(+)DNA(ssDNA)的丝状大肠杆菌噬菌体,其基因组大小为6.4kb。这类载体主要用来获得大量的单链DNA片段,这种单链DNA片段在遗传学研究中主要用来测定DNA序列(sanger双脱氧法)、基因的定点突变研究、异源双链DNA的分析等。 M13噬菌体的特点 感染Ecoli后,在宿主细胞内会形成双链的复制型DNA( replication form DNA, RF DNA)。可以象质粒DNA那样在体外进行纯化和操作。 成熟的噬菌体颗粒仅能感染E.coli的F+细胞,这是因为这种噬菌体的感染位点在性散毛上。但是无论是RF DNA或ss DNA都能转染E.coli的F+或F-细胞。 噬菌体颗粒的大小是受其DNA的大小制约的,这一点正好与λ噬菌体相反。所以M13噬菌体并不存在包装限制的问题。 M13单链DNA噬菌体的生命周期 RF DNA Phage M13 replication in the host cell: + RNA pol DNA polIII ± RF Nicked by gene 2 protein + ss-Rolling circle replication, then cut and ligate Coated with gene 5 protein Gene 5 protein is replaced by gene 8 protein ect. Linear M13 phagereleased from the cell. (二) M13载体的构建 (1)克隆区域的选定 ① 基因间隔区(intergenic region, IG区) J. Messing证明,IG区存在M13的复制起点,但可以插入外源DNA而不影响M13噬菌体的活力。 在IG区内插入一个大肠杆菌的LacZ’(?-肽序列)。 利用?-肽序列中的三个单一酶切位点(Bgl II、Ava II 和 Pvu I)
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