线粒体基因组测序策略及方法_沙淼.pdfVIP

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2017-06-03 发布于福建
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线粒体基因组测序策略及方法_沙淼.pdf

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应用昆虫学报 Chinese Journal of App lied Entomology 2013 ，50 (2):293 － 297 ． DOI :10 ． 7679 /j ． issn． 2095 － 1353． 2013． 039 线粒体基因组测序策略和方法* 沙淼林立亮李雪娟黄原＊＊ (陕西师范大学生命科学学院西安 7 10062) ， DNA 摘要本文综述了线粒体基因组测序策略和方法在传统测序方法中介绍了基于物理分离线粒体的克隆 PCＲ， PCＲ文库测序方法和基于扩增产物的直接测序方法后者重点介绍了基于长扩增产物的引物步移法和基于 DNA ; DNA ， mtDNA 总的引物步移法应用新一代高通量测序方法有基于总样品的方法包括需要预扩增的多物种 mtDNA ，ＲNA 。，平行高通量和无需预扩增的高通量方法基于总样品的转录组测序方法等在实际工作中选择哪、、。， PCＲ种方法取决于研究规模样品大小和保存状态经费情况等总的来说基于长扩增产物的引物步移法尤其，，NGS 适合小规模昆虫线粒体基因组研究而对于大规模线粒体基因组研究来说技术无疑是省时省力的最佳选择。， PCＲ，，关键词线粒体基因组长引物步移法高通量测序 Strategy and methods for sequencing mitochondrial genome SHA Miao LIN Li-Liang LI Xue-Juan HUANG Yuan ＊＊ (College of Life Science ，Shaanxi Normal University ，Xi ’an 7 10062 ，China) Abstract This paper reviews strategy and methods for sequencing mitochondrial genomes． Two traditional sequencing methods are introduced ;the clone library-based sequencing method from physically purified mtDNA ，and the PCＲ amplicon-based sequencing method ，which includes primer-walking sequencing from long PCＲ amplicons and primer- walking sequencing from total DNA． For the application of next-