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人类基因组计划DNA提取剖析
人类基因组计划DNA提取
方法
DNA提取的实验步骤
(一)材料与设备
1.试剂:消化液(100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl,pH8.0,25mmol/L EDTA,0.5%SDS,
0.1mg/ml蛋白酶K);pH8.0,25mmol/L EDTA;PBS;TES饱和酚;氯仿;异戊醇; 95%
乙醇溶液;70%乙醇溶液;TE;0.1%SDS;
2.仪器:培养皿、培养瓶、微量离心管、滴管;刻度吸管;加样器;枪头;离心机、液氮罐、组
织匀浆器、恒温培养箱。
Tris 中文名:三羟甲基氨基甲烷;
性状:白色结晶 水溶液无色,澄清;
作用:作为核酸和蛋白质的溶剂。
Tris-Hcl缓冲液由Tris和Hcl混合而成。
EDTA中文名:乙二胺四乙酸;
性状:白色粉末,能溶于氢氧化钠、碳酸钠及氨溶液中,能溶于160分沸水,微溶于冷水,溶
于乙醇、丙酮及部分有机溶剂;
作用:用于排除大部分过度金属元素离子(如铁,镍,锰)的干扰。
SDS中文名:十二烷基硫酸钠 ;
性 状:白色或浅黄色结晶或粉末。有特殊气味。在湿热空气中分解。易溶于水,溶于热醇;
作用:在DNA提取中,高浓度的阴离子去垢剂 SDS使DNA 与蛋白质分离。
PBS中文名:磷酸盐缓冲溶液,一般选择Na2HPO4和KH2PO4配制;
作用:PBS一般用作支持电解质。
tes饱和酚作用:将DNA层与变性蛋白质层分离。
氯仿 性状:无色透明重质液体,极易挥发,有特殊气味;
作用:与异戊醇混合以抽提DNA。
异戊醇性状:无色液体,有令人不愉快的气味;
作用:与氯仿混合抽提DNA。
乙醇 作用:促使DNA沉淀。
TE缓冲液:由Tris和EDTA配置而成的,主要用于溶解DNA,能稳定储存DNA
(二)主要步骤
1.如果材料为组织块,可将组织块(约200~1000mg)剪碎后,置入液氮中。随后用冰冷的组
织捣碎器捣碎,每100mg组织加入1.2ml消化液(100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-HCl,
pH8.0,25mmol/L EDTA,0.5%SDS,0.1mg/ml蛋白酶K)。
2.如果材料是悬浮细胞,收集细胞于微量离心管中,500g×5min离心;如果材料是贴壁细胞,
弃上清后,胰酶消化收集细胞,500g×5min离心。随后用冰冷的PBS缓冲液洗涤细胞,
500g×5min离心,弃上清,重复一次,并用一倍体积的消化液重悬细胞。
3.组织或细胞混悬液移入带盖的离心管中,50℃消化12~18h。
4.冷却至4℃,加等体积15 mo1/L TES饱和酚。
5.轻轻振摇,使水相和酚层充分混匀。
6. 4℃5000rpm~8000rpm离心15min~20min。此时DNA溶液在上层,酚位于下层,中间是变
性蛋白层。
7.用吸管小心吸取上层粘稠溶液,移至另一离心管。注意尽量不要带出中间蛋白层
8. DNA溶液再加等体积15 mo1/L TES饱和酚抽提一次,按6、7离心并吸至另一离心管。
9.加等体积氯仿/异戊醇按步骤(5、6)抽提,离心5min。
10.吸出DNA溶液后,再步骤(9)抽提一次。
11.用吸管将DNA溶液移至Eppendorf中,冰浴至0℃。
12.加2.5倍体积95%冷乙醇震摇,可见DNA白色沉淀析出。
13.用75%冷乙醇清洗3~4次。
14.室温干燥或冷冻干燥DNA。
15.加适量TE溶液溶解DNA。
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