第七章 蛋白质分析软件-ANTHEPROT上机指导.ppt

ANTHEPROT 介绍 生物的化学，就是蛋白质与核酸的化学。对蛋白质的研究是生物化学领域一个非常重要的部分。近年来，通过实施基因组计划，得到了大量的蛋白序列数据，但是，面对如此众多的蛋白质序列数据，其分析工作是一个非常困难的工作。用人工的方法是不可能完成如此大量的分析工作的。运用计算机，利用一定的运算规则，进行蛋白序列分析是唯一的方法。蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 5.0正是这样的一个程序。 蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 5.0是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。 软件包为一个自解压执行文件，文件名Anthe5_0.exe，大小为1.9兆。执行此文件，输入解压后存放的目录名，便可将所有文件解压在此目录下。主程序名为Anthewin，在桌面上建立它的快捷图标，双击快捷图标便打开了ANTHEPROT 5.5主窗口。通过主程序，我们可以载入蛋白序列，对序列进行编辑、打印、拷贝、改变设定等操作，更重要的是，我们可以在此调用各种所需的分析工具，对蛋白序列进行分析。 软件包为一个自解压执行文件，文件名Anthe5_0.exe，大小为1.9兆。执行此文件，输入解压后存放的目录名，便可将所有文件解压在此目录下。主程序名为Anthewin，在桌面上建立它的快捷图标，双击快捷图标便打开了ANTHEPROT 5.5主窗口。通过主程序，我们可以载入蛋白序列，对序列进行编辑、打印、拷贝、改变设定等操作，更重要的是，我们可以在此调用各种所需的分析工具，对蛋白序列进行分析。 一． 序列编辑功能 一． 序列编辑功能 一． 序列编辑功能 一． 序列编辑功能 二．工具栏与基本功能 二．工具栏与基本功能 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 三．基本分析工具介绍 四．结果的输出以及与其它应用程序进行数据交换 四．结果的输出以及与其它应用程序进行数据交换 ExPasy功能简介 ExPasy功能简介 ExPasy功能简介 ExPasy功能简介 ExPasy功能简介 ExPasy功能简介 如何引用ExPasy 数据库 数据库 下载服务 软件和工具 序列和分析工具 序列和分析工具 蛋白质组学工具 蛋白质组学工具 蛋白质组学工具 9. 选定一个片段后，绘制Helical Wheel图 ANTHEPRO5.0还可先选定一个蛋白片段，绘制其Helical Wheel图。单击 按键或选取Methods/ Helical Wheel便可进行计算与绘制。在二级结构预测输出窗口，用鼠标左键定义起始点，用鼠标右键定义结束点，选择菜单命令Helical Wheel，也可很方便的绘制此定义片段的Helical Wheel图 输出图形的例子如下 ： 10. 进行潜在的信号肽与断裂位点预测 ANTHEPRO5.0还对输入的蛋白片段，进行潜在的信号肽与断裂位点预测。单击 按键或选取Methods/Potential cleavage site of signal pept.，再选择是原核序列或或者真核序列便可进行预测。 输出结果举例如下： ?ANTHEPRO4.3所输出的所有文字、结果图形与曲线，均可以打印，也可以拷贝到剪贴板，粘贴到其它应用软件如WORD中，或者输出为*.BMP格式的文件，使用其它软件进行再编辑。程序的缺省设置将输出图形背景色设为黑色，在所有图形输出窗口，均可以以Invert Mode（即黑白反色模式）输出，或者可以在Options菜单由用户定义背景与前景色颜色。这样，可以将黑色背景反转为白色，符合我们的习惯，打印时也节约些墨水。 ANTHEPRO5.0蛋白质分析软件包的简单介绍到这里就结束了，本文只是对此软件进行了一个粗略的介绍，许多细节的用法还有待大家去发掘。总的来说，ANTHEPRO4.3蛋白质分析软件包可以极大地加快研究蛋白序列的速度，并且能够获得具有发表质量的图表与数据，它对生物化学工作者来说，是一个不可多得的好软件。可以