基于cDNA宏阵列的系统聚类分析猪发育阶段的基因表达谱.pdfVIP

( ) 第 50 卷 第 4 期 武汉大学学报 理学版 Vol. 50 No. 4 　 　2004 年 8 月 J . Wuhan Univ. (Nat . Sci. Ed. ) Aug. 2004 ,482～486 ( ) 文章编号 : 2004 基于 cD NA 宏阵列的系统聚类分析 猪发育阶段的基因表达谱 1 1 2 1 1 1 1 1 朱正茂 , 赵书红 , 陈 浩 , 余 梅 , 刘 榜 , 樊 斌 , 朱猛进 , 李 奎 ( 1. 华中农业大学 动物科技学院 , 湖北 武汉 430070 ; 2. 华中农业大学 理学院 ,湖北 武汉 430070) 　　摘 　要 : 取杜洛克猪胚胎第 33 ,45 ,55 ,65 ,75 天的背最长肌样本 ,用 cDNA Macroarray 分析方法和聚类分析技 术分析了 327 个 EST 在骨骼肌内不同发育阶段的基因表达谱 ,结果表明有 98 条 EST 在不同发育时期显著差异表达. 第 33 天和第 45 天两阶段基因表达状态相似 ,第 55 天和第 65 天基因表达状态相似 ,而第 75 天的基因表达与第 55 天 和第 65 天两个阶段的基因表达具有相近的聚类关系. 表达状态相近 ,基因功能相似的基因大都被聚类在一起. 关 　键 　词 : cDNA Macroarray ; 猪 ; 胚胎 ; 骨骼肌 ; 发育 ; 聚类分析 中图分类号: Q 953 　　　文献标识码 :A 0 　引　言 1 　材料与方法 ( 　　cDNA 阵列技术 包括 cDNA Macroarray 和 cD 1 . 1 　材 　料 NA Microarray) 可以一次并行检测成千上万个基因 分别采取纯种杜洛克猪胚胎发育第 33 ,45 ,55 , 的表达情况 ,现在已经发展成为一种成熟的技术. 随 65 ,75 天的背最长肌样本 , 置于液氮中保存备用. ( 着猪各种组织的表达序列标签 expression sequence 327 个 EST 克隆由爱荷华州立大学的 C. K. Tuggle tag ,EST) 大规模测序工作的进展 ,构建猪基因组微 ( ) 阵列芯片已经成为可能[1 ] . 猪的经济性状多为数量 教授惠赠. 这些克隆分别来自猪胚胎 20 d 和 45 d 和成年猪骨骼肌 cDNA 文库. 性状 ,其表现型由多基因的表达调控来决定. 因此 ,