基于支持向量机生物医学文献蛋白质关系抽取.pdfVIP

第 3卷第 4 期 　　　 　　　　 　　　　　　　智 　能 　系 　统 　学 　报 　　　　 　　　　 　 　 　　Vo l. 3 №. 4 2008年 8月 　　　　　　　　　 　　CAA I Tran saction s on In telligen t System s 　　　 　　　　　　　　　A ug. 2008 基于支持向量机的生物医学文献蛋白质关系抽取 1 2 1 1 杨志豪 ,洪 　莉 ,林鸿飞 ,李彦鹏 ( 1. 大连理工大学 电子与信息工程学院 ,辽宁 大连 116024; 2. 朝阳师范高等专科学校 数学计算机系 ,辽宁 朝阳 122000) ( ) 摘 　要 :从生物医学文献中抽取蛋白质 基因 交互作用关系对蛋白质知识网络的建立 、蛋白质关系的预测以及新药 ( ) ( ) 的研制等均具有重要的意义. 提出了一种基于支持向量机 SVM 的蛋白质 基因 交互作用关系抽取方法. 该方法除 了选取词项特征 、关键词特征 、实体距离特征 、链接特征外 ,还利用链接语法分析方法可以获得较高准确率的特性 , 引入链接语法分析方法抽取结果特征. 实验结果表明 ,该方法的召回率性能与使用同一测试语料的其他系统相比具 有明显的优势 ,综合分类率 F 指标也高于其他系统. 关键词 :关系抽取 ;链接语法 ;支持向量机 中图分类号 : TP39 1　文献标识码 : A 　文章编号 :(2008) 04 036 109 Extraction of informa tion on prote inprote in in teraction from b iom ed ica l litera tures using an SVM 1 2 1 1 YAN G Zh ihao , HON G L i , L IN Hongfei , L I Yanp eng ( 1. Co llege of E lectron ic and Inform ation Engineering, D alian Un iversity of Techno logy, D alian 116024 , Ch ina; 2. D ep artm en t ofM ath em atics and Compu ter, Chaoyang Teachers College, Chaoyang 122000 , Ch ina) A b stract:A u tom ated extraction of p roteinp rotein in teraction inform ation from b iom edical literatu re is help fu l when bu ild ing a p rotein know ledge network , p redicting p rotein function s and de sign ing new drugs. Th is p ap er p re sen ts a m ethod for p roteinp rotein in teraction extraction from b iom ed ical literatu re u sing a support vector m ach ine ( SVM ) . In th is m ethod, be side s common index p aram