高通量测序与其在食物网解析中的应用进展.PDFVIP

第 ３７ 卷第 ８期 生 态 学 报 Ｖｏｌ．３７，Ｎｏ．８ ２０１７年４月 ＡＣＴＡ ＥＣＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ Ａｐｒ．，２０１７ ＤＯＩ：１０．５８４６／ ｓｔｘｂ２０１５１１１６２３１７ 王雪芹，王光华，乔飞，高其康，Ｋｏｎｇ Ｌｕｅｎ ＨＥＯＮＧ，祝增荣，程家安．高通量测序及其在食物网解析中的应用进展．生态学报，２０１７，３７（８）： ２５３０⁃２５３９． Ｗａｎｇ Ｘ Ｑ，Ｗａｎｇ ＧＨ，ＱｉａｏＦ，Ｇａｏ ＱＫ，ＫｏｎｇＬｕｅｎ ＨＥＯＮＧ，ＺｈｕＺ Ｒ，ＣｈｅｎｇＪＡ．Ｐｒｏｇｒｅｓｓｏｎｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇａｎｄｉｔｓａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓｉｎｆｏｏｄ ｗｅｂ ａｎａｌｙｓｉｓ．Ａｃｔａ Ｅｃｏｌｏｇｉｃａ Ｓｉｎｉｃａ，２０１７，３７（８）：２５３０⁃２５３９． 高通量测序及其在食物网解析中的应用进展 １，２ １，２ １，２ ２，３ １，２ １，２ 王雪芹 ， 王光华 ， 乔　 飞 ， 高其康 ， Ｋｏｎｇ Ｌｕｅｎ ＨＥＯＮＧ ，祝增荣 ， 程家安１，２，∗ １浙江大学水稻生物学国家重点实验室，杭州　 ３１００５８ ２ 浙江大学昆虫科学研究所，杭州　 ３１００５８ ３ 浙江大学农生环学部分析测试中心，杭州　 ３１００５８ 摘要：高通量测序是ＤＮＡ测序技术发展中的重大突破，它的出现为现代生物科学研究提供了前所未有的机遇，例如基于猎物和 寄主植物ＤＮＡ分子解析生态系统的食物网研究已逐渐成为捕食性动物与植食性动物食物网研究的新型模式。 在简要总结 Ｒｏｃｈｅ４５４、Ｉｌｌｕｍｉｎａ和Ｉｏｎ Ｔｏｒｒｅｎｔ为代表的第二代测序技术的原理及最新进展的基础上，综述了近年来利用高通量测序技术在 捕食性和植食性动物食物网解析构建研究方面取得的最新进展及存在的问题，以期为探索捕食性和植食性动物的猎物／ 寄主范 围、猎物／ 寄主转换、资源分配、生物防治、生物保护和生态恢复新方法提供思路和启发。 关键词：第二代测序；捕食／ 植食性动物；营养关系；食物转换；宏条形码技术 Ｐｒｏｇｒｅｓｓ ｏｎ ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｉｔｓ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｆｏｏｄ ｗｅｂ ａｎａｌｙｓｉｓ １，２ １，２ １，２ ２，３ １，２ １，２ ＷＡＮＧ Ｘｕｅｑｉｎ ，ＷＡＮＧ Ｇｕａｎｇｈｕａ ，ＱＩＡＯ Ｆｅｉ ，ＧＡＯ Ｑｉｋａｎｇ ，Ｋｏｎｇ Ｌｕｅｎ ＨＥＯＮＧ ，ＺＨＵ Ｚｅｎｇｒｏｎｇ ， ＣＨＥＮＧＪｉａａｎ１，２，∗ １ＳｔａｔｅＫｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ ＲｉｃｅＢｉｏｌｏｇｙ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ ３１００５８，Ｃｈｉｎａ ２Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｉｎｓｅｃｔ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ ３１００５８，Ｃｈｉｎａ ３Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｃｅｎｔｅｒ ｏｆ Ａｇｒｏｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｚｈｅｊｉａｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｎｇｚｈｏｕ ３１００５８，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｈｉｇｈ⁃ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｉｓ ａ ｍａｊｏｒ ｂｒｅａｋｔｈｒｏｕｇｈ ｉｎ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｐｒｏｖｉｄｅｓ ａｎ ｕｎｐｒｅｃｅｄｅｎｔｅｄ ｏｐｐｏｒｔｕｎｉｔｙ ｆｏｒ ｍｏｄｅｒｎ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ ｒｅｓｅａｒｃｈ，ｓｕｃｈ ａｓ ｔｈｅ ＤＮＡ⁃ｂａｓｅｄ ａｐｐｒｏａｃｈ ｔｒａｃｋｉｎｇ ｔｈｅ ｆｏｏｄｃｈａｉｎｓａｍｏｎｇｐｒｅｄａｔｏｒｓ⁃ｐｒｅｙ ｏｒｈｅｒｂｉｖｏｒｅｓ⁃ｈｏｓｔ ｐｌａｎｔｓｔｒｏｐｈｉｃｉｎ