遗传等距离现象_ 分子钟及中性理论的误读及其近半世纪后的重新解谜.pdfVIP

中国科学: 生命科学 2013 年 第43 卷 第4 期: 275 ~ 282 SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS 评 述 遗传等距离现象: 分子钟和中性理论的误读及其近 半世纪后的重新解谜 ①② ①③ ① ① ① ①* 胡涛波 , 龙孟平 , 袁德健 , 朱作斌 , 黄益敏 , 黄石 ① 中南大学, 医学遗传学国家重点实验室, 长沙 410078; ② 中南大学湘雅二医院, 长沙 410011; ③ 中南大学湘雅医院, 长沙 410008 * 联系人, E-mail: huangshi@ 收稿日期: 2012-08-29; 接受日期: 2012-11-23 国家重点基础研究发展计划(批准号: 2011CB51001)、国家自然科学基金(批准号:和湖南省“芙蓉学者计划”资助项目 摘要 1963 年, Margoliash 在比对不同物种细胞色素C 序列后, 发现了出乎意料的遗传 关键词 等距离结果, 这与几乎同时间Zuckerkandl 和Pauling 的血红蛋白发现是同一现实的不同 分子进化 分子钟 反映. 一个就事论事的分子钟假说因而被提出, 并长期被某些学者认为是真实的自然现 中性理论 象, 导致 Kimura 提出中性理论来解释分子钟. 多年的研究发现了无数矛盾, 分子钟仅有 遗传等距离现象 有限的局部存在. 但被忽略的是, 分子钟的瓦解自然使遗传等距离成为未解之谜. 近年 最大遗传变异假说 来, 本实验室偶然重新发现了这一至今还几乎无人知晓、并未被充分重视的现象. 通过整 小进化 大进化 合现有理论的正确内容, 并引入最大遗传变异极限这一原创概念, 提出了一个更全面的 极限遗传距离 遗传进化学说, 重新解读了遗传等距离及其他主要进化现象. 该假说将改写物种亲缘关 系树及群体遗传学, 并解决一些现有理论给不出线索的生物医学难题. 生物学中最受关注的研究之一是物种的生殖遗 在分子进化领域可以用序列相似性的高低来表示, 传及进化. 生物进化包括表型和分子, 现行最具代表 即两个物种的同源蛋白或 DNA 序列之间有差别的氨 性的表形和分子进化理论分别是自然选择理论和轻 基酸残基或 DNA 碱基数目占该蛋白或 DNA 序列的 视自然选择的中性理论, 它们共同组成了现代进化 氨基酸残基或 DNA 碱基总数的百分比. 理论. 中性学说是 Kimura, Jukes 和 King 为了解释分 在 3 个或更多直觉看来, 复杂性不同的物种之间 子钟而提出的[1,2], 但分子钟真的是一个普遍现象吗? 进行同源基因比对, 可以有两种不同的方式. 第一种 比对, 用某一复杂物种, 如人与各个低级物种比对, 1 分子钟及中性理论提出的历史: 分子钟 会发现人与青蛙近, 与鱼远( 图 1A). 任何受过中学教 是如何取代遗传等距离现象的? 育的人都可轻易理解这个问题. 第二种比对与第一 遗传