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核酸的化学剖析
第二章 核酸化学; 第一节 概 述
一.核酸的发现
二.核酸的种类和分布
脱氧核糖核酸 DNA 细胞核的染色体中(真核)
类核结构中(原核)
核糖核酸 RNA 细胞质中
三.核酸的主要功能
DNA是遗传信息的载体
RNA 在蛋白质的合成中起重要作用;
核酸是由什么组成的?
1. 核酸的组成:核酸是生物体内的高分子化合物。它包括脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid, DNA)和核糖核酸(ribonucleicacid, RNA)两大类。DNA和RNA都是由一个一个核苷酸(nucleotide)头尾相连而形成的。RNA平均长度大约为2000个核苷酸,而人的DNA却是很长的,约有3X109个核苷酸。单个核苷酸是由含氮有机碱(称碱基)、戊糖和磷酸三部分构成的。;;碱 基;碱 基;碱 基;戊 糖;戊 糖;核 苷;核 苷;核 苷 酸;核 苷 酸;ATP(三磷酸腺苷)的??构;AMP的结构;dAMP \dADP\dATP ;第三节 DNA及其结构;
1. DNA的一级结构
DNA的一级结构是由数量极其庞大的四种脱氧核糖核酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)按一定顺序,通过3′,5′磷酸二酯键连成的直线形或环形分子。;1. DNA的一级结构
3’,5’-磷酸二酯键:核酸是由众多核苷酸聚合而成的多聚核苷酸(polynucleotide),相邻二个核苷酸之间的连接键即:3’,5’-磷酸二酯键。这种连接可理解为核苷酸糖基上的3'位羟基与相邻5'核苷酸的磷酸残基之间,以及核苷酸糖基上的5'位羟基与相邻3'核苷酸的磷酸残基之间形成的两个酯键。多个核苷酸残基以这种方式连接而成的链式分子就是核酸。无论是DNA还是RNA,其基本结构都是如此,故又称DNA链或RNA链。;核酸链的简写式:核酸分子的简写式是为了更简单明了的叙述高度复杂的核酸分子而使用的一些简单表示式。它所要表示的主要内容是核酸链中的核苷酸(或碱基)。
——线条式/字母式/结构式
;字符式:书写一条多核苷酸链时,用英文大写字母缩写符号代表碱基(DNA和RNA中所含主要碱基及缩写符号见表1-1),用小写英文字母P代表磷酸残基。核酸分子中的糖基、糖苷键和酯键等均省略不写,将碱基和磷酸相间排列即可。因省略了糖基,故不再注解“脱氧”与否,凡简写式中出现T就视为DNA链,出现U则视为RNA链。以5'和3'表示链的末端及方向,分别置于简写式的左右二端。
5‘GGAATCTCAT 3’3‘CCTTAGAGTA 5';线条式:在字符书写基础上,以垂线(位于碱基之下)和斜线(位于垂线与P之间)分别表示糖基和磷酸酯键。
斜线与垂线部的交点为糖基的C-3'位,斜线与垂线下端的交点为糖基的C-5'位。这一书写式也可用于表示短链片段。不难看出,简写式表示的中心含义就是核酸分子的一级结构,即核酸分子中的核苷酸(或碱基)排列顺序。; DNA结构的表示法;寡核苷酸(oligonucleotide):这是与核酸有关的文献中经常出现的一个术语,一般是指二至十个核苷酸残基以磷酸二酯键连接而成的线性多核苷酸片段。但在使用这一术语时,对核苷酸残基的数目并无严格规定,在不少文献中,把含有三十甚至更多个核苷酸残基的多核苷酸分子也称作寡核苷酸。寡核苷酸目前已可由仪器自动合成,它可作为DNA合成的引物(primer)、基因探针(probe)等,在现代分子生物学研究中具有广泛的用途。
;2.DNA的二级结构;dGTP;DNA 的 结 构;dGTP;DNA的双螺旋结构;DNA的双螺旋结构;;;;(4)DNA双螺旋结构的多态性;A-DNA B-DNA H-DNA; B-DNA Z-DNA;(5) DNA的其它螺旋结构; 回文结构—DNA序列中以某一中心区域为对称轴,其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同的双螺旋结构。即对称轴一侧的片段旋转180°后,与另一侧片段对称重复。 回文结构能形成十字结构和发夹结构;;3.DNA的三级结构;3.DNA的三级结构;线状DNA形成的超螺旋;环状DNA形成的超螺旋; 多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的DNA螺旋区段,其序列中有较长的镜像重复时,形成局部三股配对,并互相盘绕的三股螺旋,其中两股的碱基按Watson-Crick方式配对,第三股多聚嘧啶(镜像重复)通过TAT和CGC+配对,而处于双螺旋的
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