基于MATLAB的神经科学工具包Cogent及其编程实现.pdfVIP

4t!-[龙 江 省 政 法 管 理 -T-部 学 院 学 报 No．1 2016 2016年第 1期 (总第 118期) JournalofHeilongjiangAdministrativeCadreCollegeofPoliticsAndLaw (SumNo．I18) 基于 MATLAB的神经科学工具包Cogent及其编程实现 温 菲 ，岳金星 (1．哈尔滨商业大学外语学院，哈尔滨 150028；2．哈尔滨工业大学 语言文学学院，哈尔滨 150001) 摘要：神经科学研究中，高质量实验数据的采集依赖于时间精度高、功能强大的编程工具，从而精准的呈现刺激材料和收 集受试的反应。Cogent便是这样一款基于MATLAB平台的神经科学实验工具包。该工具包诞生于伦敦大学学院，可呈现并 编写听觉、视觉以及动画刺激材料，以应用于行为、脑电、功能磁共振成像等神经科学实验 中。Cogent程序编写的核心有两个， 第一，需要 了解Cogent在呈现不同类型刺激时的特殊句法；其二，成功的编程还在于理解程序脚本、缓存分配和数据文件之间 的分配与调用关系。由于Cogent编程语法接近 自然语言，十分容易上手，非常适合不同背景的神经科学研究人员使用。 关键词：神经科学；MATLAB工具包；编程；刺激呈现 中图分类号：TP31 文献标志码：A 文章编号：1008—7966(2016)01—0154—03 在神经科学研究中，通用实验编程工具种类繁多，既有 像 E—Prime，Presentation，Inquisit等付费商业软件 ，亦有如 二、Cogent的安装与程序基本编写原则 DMDX等免费的开放程序 “J。随着数学计算工具 MAT— LAB (TheMathWorksInc．)的不断普及，基于该平台编写的 1．Cogent的安装 实验工具包为神经科学实验带来了便利，例如呈现刺激常用 在伦敦大学学院神经生物学实验室的网站上 (www．vis— 的编程工具包PsychtoolboxJ。基于MATLAB的工具包具有 lab．ae．uk／cogent．php)研究人员可以免费下载Cogent。解压 免费，精度高，可扩展性和研究适应性强等特点。本文介绍 缩Cogent压缩包之后会在与压缩包同名的文件夹中出现3 另一种面世时间不长，面向实验编写的MATLAB工具包 ， 个子文件夹，分别是：Documents，Samples，Toolbox。在 Docu— Cogento ments文件夹中包括所有和 Cogent有关的使用手册 ；Samples 文件夹中是经过严格测试可运行的代码，供研究人员编程时 一 、 Cogent简介 参考；Toolbox中主要包括 Cogent各 函数的MATLAB脚本。 在 MATLAB环境下，用 “SetPath”加载Cogent中各文件夹 目 Cogent工具包诞生于英国伦敦大学学院，由于Cogent通 录至MATLAB路径之后，即可运行含有 Cogent函数的程序 过更加易懂的独立语法调用 MATLAB的底层函数 ，这极 脚本。 大降低了使用的难度 。Cogent以卓越三的视觉图形刺激 2．Cogent程序编写基本原则 处理而著称 ，亦可以呈现文字和听觉刺激 ，并能够精准地收 一 个可以运行的Cogent实验程序包括Cogent程序代码、 集受试的反应时间。 刺激材料和数据文件。Cogent代码规定实验如何运行 (例如 Cogent分为三个层次结构 J。底层结构包括 MATLAB、 一 个词呈现时间的长短)；数据文件 (可以为 txt格式或 dat Window操作系统和DirectX工具 ；中间结构包括以．dll为后 格式)是程序代码和刺激材料的中介，实验运行中，Cogent通 缀的低级函数