热气腾腾的5分SCI-LncRNAceRNA.docVIP

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热气腾腾的5分SCI——LncRNA ceRNA 2014-10-22?右哉?实验万事屋 提示:请点击标题下方蓝色“实验万事屋”,添加关注后,发“嗯”可以查看我们之前的文章。未经允许,其他公众号不得转载哦! 实验万事屋作品 今天是每周三的【万事屋Seminar】,今天要给大家介绍的是一个热气腾腾的关于“HOTAIR”(一种LncRNA)的文章,同时为大家介绍了一种常见的SCI文章思路……简单粗暴,但很实用哦! Seminar环节讲文献的是我们的林平之师弟,他带来的题目是《Lnc RNA HOTAIR functions as a competing endogenous RNA to regulateHER2 expression by sponging miR-331-3p in gastric cancer》 实验万事屋作品 LncRNA和ceRNA,这篇文章发表在Molecular Cancer上,影响因子是5.397。 实验万事屋作品 实验万事屋作品 LncRNA,并且发现了这个LncRNA是收到了MiRNA调控的。紧接着,就验证了这个LncRNA的一种机制,这种机制是什么呢?就是作为Her2的内源竞争RNA,对Her2这种癌基因有调控的机制。 实验万事屋作品 实验万事屋作品 实验万事屋作品 178对病例组织样本(癌和癌旁)中,验证了HOTAIR这个LncRNA的表达情况,证明分期晚的胃癌患者中,HOTAIR表达量高。且高表达HOTAIR后,生存率下降。(莫愁:验证了基因与肿瘤的相关性) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 2HOTAIR及过表达HOTAIR后增殖变化明显,即敲除HOTAIR后细胞增殖抑制。(莫愁:细胞层面实验,验证基因与肿瘤细胞表型之间的相关性) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 3HOTAIR及过表达HOTAIR后细胞周期变化,及细胞迁移能力变化。同样,在敲除HOTAIR后细胞出现早凋,迁移能力降低。(莫愁:其实都是细胞水平的实验,验证的也是基因与表型间的关系) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 4HOTAIR后,裸鼠成瘤的变化,即在敲除HOTAIR后裸鼠成瘤明显变小,增殖速度减缓。(莫愁:在细胞实验后,用裸鼠成瘤这样的简单动物实验进行进一步的体内验证,是常见的套路之一) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 5HOTAIR的MiRNA,然后用Luciferase来进行验证,获得确实有效的几个MiRNA,如MiR-331-3p。由于MiR-331-3p的靶基因也同时包含了HER2,故检测了一下HER2的表达,发现过表达HOTAIR之后,HER2表达量也增加了。(莫愁:用简单的方法,检测出了LncRNA上游的MiRNA调控,并且还预测了可能存在的ceRNA关系) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 6HOTAIR与MiRNA间的表达相关性,以及HOTAIR与HER2之间的表达相关性(qPCR及免疫组化),并验证了敲减MiR-331-3p等上游MiRNA敲减后的细胞水平表型。(莫愁:至此证明了,HOTAIR与HER2在胃癌中存在着ceRNA的联系,其联系的关键就为MiR-331-3p) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 实验万事屋作品 实验万事屋作品 5分文章。给你用图演示一下这个思路啊。是不是思路很简单,要是没有LncRNA和ceRNA这样的噱头,应该分也不会很高的。 实验万事屋作品 实验万事屋作品 HOTAIR不是在肿瘤里都研究烂了么,还有还有,MiR-331-3p不是也研究烂了么,为啥还能发5分呢?哈哈哈……这要涉及到一种SCI的科研思路,一般我们称之为“Filling Gaps”。(如下图) 实验万事屋作品 实验万事屋作品 ?A?蛋白是?B?蛋白的上游蛋白,另外有人报道?B?蛋白是?C?蛋白的上游,但是?A?和?C?蛋白之间的关系就是个?gap,无人报道,所以我就研究?A?和?C?的关系,这种结果一般都是可以预测的,创新性不大,尽管如此,这类的发现也照样可以发表文章,只是不大可能入?CNS(Cell, Nature,Science)之类的牛刊的法眼。 实验万事屋作品 S003”。什么?还不了解ceRNA是啥?那就回复“147”吧。好了,今天就策到这里了! 如果你喜欢我们,欢迎把文章转发到朋友圈!未经允许,其他公众号不得转载哦! 举报

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