基于PCR的水稻候选RGA标记检验和评估.PDFVIP

( ) 　33 ( 1) : 5 1～55 , 2007 浙江大学学报 农业与生命科学版 Journal of Zhej iang University (A gric Life Sci) 文章编号 (2007) 0 1005 105 基于 PCR 的水稻候选 RGA 标记检验和评估 肖天霞 , 赵向前 , 汪旭升 , 吴为人 , 朱 军 (浙江大学 农业与生物技术学院 , 浙江 杭州 3 10029) 摘 　要 : 在生物信息学方法开发的基于 ePCR 、共显性的 402 个水稻候选 R GA 标记的基础上 ,随机挑 选 40 对引物 ,分别以水稻品种 Nipponbare 和 9311 的DN A 为模板进行 PCR 扩增验证. 得到清晰条带 ( ) 占所用标记总数的 875 % 35 个标记 ,其中3 1 对引物为共显性标记 ,4 对引物为显性标记. 用这 3 1 对 R GA 引物在 24 个水稻品种中进行 PCR 扩增 ,结果表明标记具有很好的通用性和特异性. R GA 引物平 ( ) 均标记多态性指标 P I C 值为 046 ,标记具有较好的多态性. 关 　键 　词 : 水稻 ; R GA 标记 ; PCR 中图分类号 : Q7 　　　文献标识码 : A XIAO Tianxia , ZHAO Xiangqian , WAN G Xusheng , WU Weiren , ZHU J un ( College of A g riculture and ) B iotechnology , Zhej iang Univers ity , H angz hou 310029 , China Examination and evaluation of PCRbased candidate RGA markers in rice. Journal of Zhej iang U niver sit y (A gric Life Sci) , 2007 ,33 ( 1) :5 155 Abstract : Ba sed on 402 codominant rice candidat e R GA marker s develop ed by bioinformatics met ho ds , 40 p air s of p rimer s were randomly select ed to t est t he polymorp hi sms in rice two sub sp ecies , j ap onica and i n d ica. The result s showed t hat 875 % (35 marker s) of t he tot al number of marker s obt ained t he clear bands , which 3 1 marker s were codominant and 4 marker s were dominant . In addition , 3 1 p rimer p air s were u sed to analyze 24 different j ap onica and i n d ica varieties , and t he result showed t he marker s have goo d commonalit y and sub sp ecies