乙酰胆碱酯酶抑制剂虚拟筛选方法研究.PDFVIP

维普资讯 第 20卷 第 5期 计算机与应用化学 Vo1．20，No．5 2003年 9月 28 日 ComputersandAppliedChemistry September，2003 乙酰胆碱酯酶抑制剂虚拟筛选方法研究 刘艾林 ，杜冠华 (中国医学科学院药物研究所 ，北京 ，tooo5o) 摘要：在虚拟筛选过程中，虚拟筛选策略和方法是获取结果的基础，但需要通过实验数据来检验。获得虚拟筛选合理的限制 因素，将为大规模虚拟筛选提供方法依据。通过建立乙酰胆碱酯酶抑制剂的活性检测方法 ，检测了4OOO多个化合物的生物活 性，并发现了34个活性较高的化合物，同时将设计的6个不同的虚拟筛选方法分别用于2个乙酰胆碱醋酶抑制剂虚拟筛选模 型。将所预测 的可能活性化合物及两模型共有 的可能活性化合物分别与实验所得 的活性化合物对照，综合分析讨论虚拟筛 选乙酰胆碱酯酶抑制剂的重要因素和进一步富集活性化合物的方法 ，为大规模的虚拟筛选乙酰胆碱醋酶抑制剂提供可靠依 据，并为其他基于蛋 白酶结构的虚拟筛选提供参考。 关键词 ：虚拟筛选 ；乙酰胆碱酯酶 ；能量打分 中圈分类号：R927 文献标识码 ：A 文章编号：1001-4160(2003)05-547-550 M ethod research on virtualscreeningOfacetylchOlinesteraseinhibitors LlU Ai-LinandDU Guan-HHa (InstituteofMateriaMedica，ChineseAcademyofMedicalSciences，Beijing，100050，China) Abstract：In theprocessofvirtualscreening，variousresultsofvirtualscreeningbaseon variousvirtualscreeningstrategiesandmeht- ods．Therationalmethodsmustbegotbyexperiment，itcan instructlargescalevirtualscreening．Theassaymehtodofacetylcholinest- erase(ACHE)inhibitorswasintroducedinthispaper．Morethanfourthousandcompoundsweredetectedbyhtismehtod，and34corn- poundswiht higherbioactivitieswerefound．Basedontwocomplexcrystalstructures，twovirtualscreeningmodelwereestablishedto forecastthepossibleactivity compoundsfrom thecompoundsdetectedby applying6 differentmehtods．Thetwo setpossibleactivity compoundsofthetwomodelandthecommonpossibleactivitycompoundswerecomparedwiht hteactiviyt compoundsobtainedfrom bio- assay．Theimportantfactorsofvirtualscreeningacetylcholinesterase(AChE)inhibitorsandhtemethodstoenrichactiviytcompounds wereanalyzedanddiscussed．Someadvicesforlargescalevirtualscreeningofacetylcholinestera8e(AChE)inhibitorswereputforward． Keywords：virtualscreening，acetylcholinesterase(AChE)，energyscoring LiuAL，DuGH．Methodresearchon virtualscreeningofacetylcholinesteraseinhibitors．Compu