YNZ22位点多态性与食管癌遗传易感性论文.docVIP

　　YNZ22位点多态性与食管癌遗传易感性论文 .freelp-FLP技术，对陕西正常人群（71例）、食管癌组织（38例）及癌旁组织（31例）YNZ22-VNTR位点进行多态性分析. 结果 在正常人群中YNZ22位点共检出29种基因型，10个等位基因片段，片段大小范围在168～938bp之间，杂合度为70.42%，PIC为0.84;在食管癌中共检出YNZ22位点11种基因型，8个等位基因片段，杂合度为10.15%.freels/geics;tandem repeat sequences Abstract:AIM To observe the polymorphism of YNZ22lo-cus in71normal unrelated subjects from Han population in Shaanxi Province，and assess its possible relationship arkers of esophageal cancer.METHODS The polymorphism of YNZ22-VNTR locus p-FLP in the71normal subjects，38esophageal cancer samples and31pericancerous non-tumor samples.RESULTS T168bp to938bp al subjects.The het-erozygosity and PIC of YNZ22or tissues.The heterozygosity al subjects and that of esophageal cancer（χ2 =41.28;P 0.01，DF=7）.Among the partnerships betor tissues，mutation of YNZ22locus ent repetition number ents al subjects，and only A8allele fragment or tissues.Neither of the tents orphic geic marker.There should be a closer correlation betorphism（re-duction of core segment repetition number）and esophageal cancer susceptibility. 0 引言 食管癌是陕西常见的恶性肿瘤，具有高发和家族聚集现象.YNZ22（17p13.3）是17p末端杂合度较高的多态遗传标记位点，并与Miller-Dieker综合征密切相关.由于其位于抑癌基因p53（17p13.1）近侧，并与之连锁，故常用于肿瘤杂合性丢失（loss of het-erozygosity，LOH）的研究，间接提示抑癌基因p53的突变情况.迄今国内外尚末见到关于YNZ22位点多态性分布与食管癌遗传易感性关系的报道，我们应用PCR-Amp-FLP技术比较了陕西汉族正常人群与食管癌人群YNZ22位点等位基因多态性分布，试图阐明YNZ22能否成为食管癌人群群体中理想的遗传易感性标记. 1 材料和方法 1.1 材料 71例正常无血缘关系的陕西汉族人群血液样本;38例鳞状食管癌标本;31例癌旁组织标本（均由唐都医院胸外科提供，癌及癌旁组织经病理组织切片确诊）. 1.2 方法 1.2.1 DNA提取 抗凝血（3～5mL）或组织块采用常规蛋白酶K，酚氯仿法进行抽提. 1.2.2 PCR反应 总反应体积30μL，内含dNTPs200μmol L-1 ，一对引物各25pmol L-1 ，Taq DNA聚合酶（华美公司）2.5IU，模板DNA约5ng.PCR引物:5’-CGAAGAGTGAAGTGCACAGG-3’和5’-CACAGTCTTTATTCTTCAGCG-3’（赛百盛公司）.PCR程序:94℃变性45s;55℃复性45s;72℃延伸60s，循环30次，最后一次循环72℃延伸10min. 1.2.3 扩增产物检测 20g L-1 琼脂糖凝胶，含溴乙锭1mg L-1 ，于扩增产物中加入1/5体积的上样缓冲液进行电泳，以100bp DNA Ladder（华美公司）为标准判型.电压4～5V cm-1 ，电泳2h，EB染色.在紫外检测仪下观察并照相. 统计学处理:基因型及等位基因频率用直接计数法，并按Hardy-，Roychoudhury AK.Sampling variances of heterozygosi- ty and geic distance ［J］.Geics，1974;76:37