CALYPSO4.0版本.PDF

CALYPSO 4.0版本 目 录 第一章 CALYPSO软件的简介和安装1 一、 程序简介1 二、 CALYPSO软件特点1 三、 CALYPSO软件主要技术2 四、 CALYPSO软件功能：2 五、 扩展阅读3 六、 错误汇报3 七、 CALYPSO软件的安装4 第二章 CALYPSO软件输入参数5 第三章 CALYPSO软件输出文件及结果分析16 八、 CALYPSO软件的输出文件16 九、 CALYPSO软件的结果分析17 第四章 CALYPSO软件高级专题19 十、 结构弛豫跨节点并行模式19 十一、 远程提交结构弛豫模式19 十二、 产生结构同结构弛豫分离模式21 第一章 CALYPSO软件的简介和安装 一、程序简介 CALYPSO(Crystal structure AnaLYsis by Particle Swarm Optimization) 是基于粒子群优化算法的晶体结构预测程序，只根据材料的化学配比和给定的外 界条件 （如压力和温度），就可以寻找体系的基态及亚稳态结构，进而可以开展 材料的结构确定，并进行有效的功能材料 （如超导，超硬及热电材料等）设计研 究。 我们课题组发展了基于粒子群优化算法的晶体结构预测新方法，首次将粒子 群优化算法应用到晶体结构预测领域，在此基础上开发了拥有自主知识产权的大 型晶体结构预测CALYPSO软件。CALYPSO软件包受中国版权局的保护，注 册号是：2010SR028200，分类号：61000-75。利用CALYPSO程序，在只给定化 学组分和外界压力的条件下对单质、化合物和分子晶体等多种类型的晶体材料进 行了结构预测测试，在很大压力范围内得到的结果与实验吻合，证明了该方法的 可靠性。CALYPSO软件克服了前人遗传算法无法考虑晶体结构对称性的缺点， CALYPSO 大大提高了结构搜寻的收敛速度。 软件的最终将适用于各种材料体系 的研究，广泛应用于结构现象丰富的研究领域中，如高压结构相变、功能材料的 设计 （如超导、超硬、热电、能源材料等）以及大分子和大尺度材料体系的结构 CALYPSO 40 700 确定。目前， 结构预测方法和程序已被 个国家和地区的 余位 科研工作者签订版权协议来使用。在Nat.Chem.,Nat.Commun.,Phys.Rev.Lett., PNAS JACS 110 和 等国际杂志发表论文 多篇。 二、CALYPSO软件特点 2.1在仅给定化学配比或者外界条件（如压力）的条件下，可以预测零维纳 米粒子或者团簇，二维层状结构和表面重构以及三维晶体结构的最稳定的或者亚 稳的结构。 2.2通过功能导向进行新型功能材料的设计，例如超硬材料和具有理想带隙 1 的光学材料。 2.3结构演化：全局粒子群优化算法、局域粒子群优化算法和对称性人工蜂 群算法等。 2.4变化学组分的结构预测。 2.5 软件兼容性强。支持同目前主流的结构弛豫和总能计算软件（包括 VASP，CASTEP，QuantumEspresso，GULP，SIESA，LAMMPS，Gaussian 以及CP2K等）的接口，更可以根据用户需求实现与其他代码的接口。 三、CALYPSO软件主要技术 CALYPSO方法的成功的主要源于其引入的几个强大的结构处理技术： 3.1通过粒子群算法进行结构演化。 粒子群优化因具有运用种群智能和自学习能力来跨越整个能量区间上的大 的势垒的能力而著名。全局粒子群优化算法的优势在于收敛快，而局域粒