nbsp; 观赏桃查尔酮合成酶基因的克隆及其序列分析.pdfVIP

园 艺 学 报 2012 ，39 （3 ）：581 –587 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 观赏桃查尔酮合成酶基因的克隆及其序列分析 * 林 玲，汤浩茹 ，陈 清，鲁 敏，贾慧峰，李英改，张晓楠 （四川农业大学园艺学院，四川雅安 625014 ） 摘 要：以观赏桃品种‘红雨垂枝’为试材，采用 SON-PCR 方法从叶片中快速获得了查尔酮合成酶 基因全长序列，命名为 PphCHS ，GenBank 登录号为 JN391444 ，其长度为2 353 bp，具有一个 1 140 bp 的 完整开放阅读框（ORF ），编码 379 个氨基酸。氨基酸同源性分析表明，PphCHS 与已报道的其他植物的 CHS 推导的氨基酸序列具有高达 90% 以上的相似性；氨基酸聚类分析表明：观赏桃首先与樱桃李聚类， 其次与草莓。生物信息学分析表明：PphCHS 蛋白含有查尔酮合酶家族的特征多肽序列 RLMMYQQG CFAGGTVLR，不含信号肽序列。 关键词：观赏桃；查尔酮合成酶基因；SON-PCR；克隆 中图分类号：S 686；S662.1 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2012 ）03-0581-07 Cloning and Sequence Analysis of Chalcone Synthase Gene in Ornamental Peach * LIN Ling ，TANG Hao-ru ，CHEN Qing，LU Min ，JIA Hui-feng ，LI Ying-gai ，and ZHANG Xiao-nan （College of Horticulture，Sichuan Agricultural University ，Ya’an ，Sichuan 625014，China ） Abstract ：The Chalcone Synthase （CHS ）coding sequence （CDS ）was cloned from the ornamental peach ‘Hongyu Chuizhi ’by using SON-PCR techiniques. It was designated as PphCHS ，and the GenBank accession number was JN391444. The full CDS was 2 353 bp in length with an open reading frame （ORF ） of 1 140 bp，encoding a protein of 379 amino acids. Homology analysis of the deduced amino acids indicated that the sequences had more than 90% similarity with those of other reported plants. Amino acids cluster analysis showed that CHS from Prunus cerasifera was clustered together with PphCHS firstly， followed by that from strawberry. Bioinformatic analysis results indicated that the PphCHS amino acids had no signal peptide sequences ，but possessed the CHS family’s characteristic sequences ，RLMMYQQG CFAGGTVLR. Key words ：ornamental peach ；chalcone synthase gene ；SON-PCR；c