辣椒CaCOI1基因的克隆、表达及其序列分析.pdfVIP

园 艺 学 报 2012 ，39 （4 ）：713 –720 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 辣椒 CaCOI1 基因的克隆、表达及其序列分析 * 胡廷章 ，陈再刚，杨俊年，吴晓丽，黄小云 （重庆三峡学院生命科学与工程学院，重庆 404000 ） 摘 要：利用 RT-PCR 技术从辣椒中克隆到基因 CaCOI1，该基因编码的蛋白质由 603 个氨基酸残基 组成，蛋白质的分子量为 68.35 kD，等电点是 6.32 。在蛋白质N –端有1 个 F-box 结构域，C –端有6 个 富含亮氨酸结构域。二级结构分析表明，CaCOI1 蛋白分子中，α–螺旋、β–折叠、β–转角和不规则卷 曲分别为 51.41%、13.76%、5.80%和 29.03% 。CaCOI1 蛋白的平均亲水系数为–0.143，为亲水蛋白。蛋 白质序列比对和进化树分析表明，CaCOI1 与番茄 LeCOI1 蛋白的一致性最高（94% ），进化距离最近。 实时定量 RT-PCR 分析表明，CaCOI1 在辣椒的根、茎、幼叶、成熟叶、花、青熟期果实、成熟红果等不 同生长发育时期的组织中都能表达，在花中表达水平最高，是其他组织的2.8 ~ 5.4 倍，表明 CaCOI1 在 花的发育过程中起重要作用。 关键词：辣椒；CaCOI1；克隆；表达 中图分类号：S 641.3 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2012 ）04-0713-08 Molecular Cloning ，Expression and Sequence Analysis of CaCOI1 from Chili Pepper * HU Ting-zhang ，CHEN Zai-gang，YANG Jun-nian ，WU Xiao-li ，and HUANG Xiao-yun （School of Life Science and Engineering ，Chongqing Three Gorges University，Chongqing 404000 ，China ） Abstract ：The cDNA sequence of CaCOI1 was cloned from chili pepper by RT-PCR. Bioinformatics analysis showed that CaCOI1 encodes a putative polypeptide of 603 amino acids with a calculated molecular mass of 68.35 kD and a theoretical pI of 6.32. CaCOI1 protein contains 51.41% α-helical domains，13.76% β-sheet domains，5.80% β-turn，and 29.03% random coil and is hydrophilic with a grand average of hydropathy value of –0.143. CaCOI1 protein was predicted to possess an F-box at the N-terminal and six leucine-rich repeat domains at the C-terminal. Multiple sequence alignments and phylogenetic tree analyses showed that CaCOI1 is close to the tomato LeCOI1 with an overall seque