细胞色素P450与链霉菌次生代谢产物的生物合成.pdfVIP

研究论文 细胞色素P405与链霉菌次生代谢产物的生物合成 李 梅，王 磊2 (’中国农业科学院植物保护研究所、植物病虫害生物学国家重点实验室，北京100094; 2东北农业大学园艺学院，哈尔滨510030) 摘 要:链霉菌中含有数量和种类众多的细胞色素产05基因，其与链霉菌次生代谢密切 相关。本文综述了链霉菌次生代谢过程中参与合成的细胞色素砂05基因及其功能和研究现 状，并分析了链霉菌细胞色素P405研究中存在问题。 关键词:细胞色素P45小 链霉菌;次级代谢产物;生物合成 1细胞色素P405及P405基因 细胞色素P45O(yctochromeP405，CYP) 是广泛存在于生物体内的一类含血红素和硫 经基的蛋白，在波长450nm处有最大吸收峰。CYP酶系在生物体中担当着生物合成和代 谢解毒两大类功能，对许多内源和外源性的化学物质尤其是对环境有害化学物质存在氧化 代谢作用，因而受到广泛的重视。近年来，每年发表的有关CYP的研究论文已超 过2000篇，是国际学术界的研究热点之一。 大多数原核生物的基本代谢中，细胞色素P405似乎不起关键作用，但有部分参与碳 水化合物、掂类及其他物质的代谢，为细菌提供单一碳源和能源，并参与各种内源性化合 物如类固醇、胆酸、脂肪酸、前列腺素、类脂化合物、生物胺及其他代谢产物的氧化、过 氧化、还原等。因此CYPs酶系被冠以多种名称:多功能氧化酶、单加氧酶、芳香烃经化 酶和药物代谢酶等。目前对CYPs的研究主要集中在其功能基因组学方面，具有降解功能 或产生新型代谢产物的转基因动物、植物和微生物的研究，以及医学领域的研究等[’一’〕。 研究显示，所有生物细胞色素P405分子来源于一个共同的祖先，它们之间存在一定 的序列保守性，即不同物种间CYP具有同源性。经典的CYP的C末端的血红素结合区有 一高度保守的F一G一G一G结构，这一基元常被用作鉴定CYP蛋白的主要特征。 细胞色素砂05基因是一个古老的超基因家族。根据酶的氨基酸序列相似性，分类并 命名为家族 (CYPI，2.二)、亚家族 (A，B.二)、单个基因 (Al，2.二)，它们的氨基酸序 列同源性分别为:40%、55%和97%闭。在一个物种内，等位基因命名为该基因 后附加一个vl，vZ…。已发现并命名的来自动物、植物和微生物的CYP基因序 列4500多条，其中不包括等位基因。 2 链霉菌中的P405基‘因 链霉菌是一类革兰氏阳性放线菌，具有复杂的形态分化特征，能产生多种具有重要应 基金项目:植物病虫害生物学国家重点实验室开放课题 (2侧沁 作简介者:李梅，女，副研究员;Tel:01。E一mali:lieelllei@mail.tsinhgu‘优gcn 科技创新与绿色植保 用价值的抗生素。在自然界已发现的近万种抗生素中，约有07%是由链霉菌产生的，这 些抗生素被广泛用于医疗、农业、环保等领域。02世纪80年代以来，随着链霉菌遗传操 作平台的构建和完善，链霉菌抗生素生物合成的分子生物学研究取得了长足发展，包括抗 生素生物合成基因簇和CYP基因的克隆、定位，基因的结构、功能、表达和调控，显示 CYP基因在链霉菌抗生素生物合成过程中发挥着重要的作用。随着2002年天蓝色链霉菌 (.socelicool;)的基因组序列解析的完成，意味着利用P405功能基因组信息，开展对链霉 菌次生代谢的研究已经成为可能。 来自细菌的P450基因中，约35%来自40种链霉菌菌株，同一链霉菌菌株中还存在 多个同一家族的基因。如阿维链霉菌 (5.二mrtiisli)的全基因组中包括33条CYP基因， 它们分别属于81个不同的CYP家族。天蓝色链霉菌 (5.ocelociol;A3 (2))全基因组序列 中含有81条cYP基因，分别属于3个不同的家族s1[。数据库查询显示tsPreot巾yce3sp.和 5.tubercidci。分别含有16和12条CYP基因。 除经过全基因组测序的5.。oeclioelr和5.omrtislii外，从其他链霉菌中发现的CYP基 因，大多数是在研究链霉菌的次级代谢过程中发现的。显示CYP存在于链霉菌的除氨基 糖昔类和脱氧糖类抗生素以外的不同类型抗生素的生物合成中 (表1)。它们