新基因AY358935的生物信息学分析和功能预测.PDFVIP

· 232 · 南方医科大学学报 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% (J%South%Med%Univ)%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%2010;30(2) 新基因AY358935 的生物信息学分析及功能预测 1 2 3 1 2 熊绍权 ，杨寒朔 ，龙奇达 （ 广州中医药大学第一附属医院肿瘤科，广东 广州 510405 ； 四川大学生物治疗国 家重点实验室 3 ，四川 成都 610041 ； 广州市妇婴医院妇产科，广东 广州 510180 ） 摘要：目的对新基因AY358935 的功能性质进行生物信息分析，为深入研究该基因功能奠定基础。 方法 利用生物信 息学分析软件，分析新基因AY358935 及其编码蛋白的性质、定位、结构、表达谱等特征，并根据相关信息预测其生物学 功能。 利用Western%blotting 检测病毒感染早期AY358935 的表达变化。 结果 AY358935 基因进化保守，与马、小鼠、斑 马鱼、非洲爪蟾的相似性分别为 、 、 、 。 亚细胞定位于线粒体的可能性大。 含有一个 末端信号肽序列 74% 60% 38% 33% N 和单次跨膜结构，多个磷酸化位点，二级结构主要是 螺旋和无规则卷曲。 在正常组织和癌组织表达广泛，并受双链 α RNA 依赖蛋白激酶的表达调控。 AY358935 蛋白表达在水泡性口炎病毒感染 2%h 后即明显上调。 结论 初步预测 AY358935 为具有重要功能的小分子分泌蛋白，可能参与细胞增殖和抗病毒天然免疫调控。 关键词： ；生物信息学；分泌蛋白；双链 依赖蛋白激酶；水泡性口炎病毒 AY358935 RNA 中图分类 ： 文献标识码： 文章编 ： Q811.4 A 1673-4254(2010)02-0232-04 Bioinformatics analysis and function prediction of the novel gene AY358935 1 2 3 XIONG%Shao-quan ,%YANG%Han-shuo ,%LONG%Qi-da 1 Department%of%Oncology,%First%Affiliated%Hospital,%Guangzhou%University%of%Traditional%Chinese%Medicine,%Guangzhou%510405,%China;% 2 3 State% Key% Laboratory% of% Biotherapy, % Sichuan