运用DNAsar比对序列.docVIP

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2017-06-14 发布于河南
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运用DNAsar比对序列.doc

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运用DNAsar比对序列

方法一在DNAstar中点击“MegAlign”程序,后出现如下界面点击“File”选择“Enter sequences”出现如下界面下面选择框中选取“All of the above”即可。在上面浏览并选中目标序列（如3)M13+_A12.seq），再点击“打开”。完成后再以同样的方法打开第二条序列，所选中的目标序列均显示在“selected sequences”框中。此时点击“Done”跳至如下界面此时即可进行两两比对。如图对测序结果3)M13+_A12.seq”与NCBI中的序列“AK352687.1 ORF.seq”进行比对。按住键盘Ctrl键选中这两条序列此时点击“Align”—“one pair” 再选择第一个或第二个选项,（一般可先尝试第二种）,出现界面点击OK转至界面此时即比对完成,再点击左上角,出现如下界面在选取show Names和show context后点击上面蓝色小方块后再点击cosensus color后的黑色方块, 点击上面红色小方块后再点击Mismatch color后的黑色方块,出现如下界面；再点将该浮框关闭,此时刻观察测序结果：蓝色区为两者一致区。红色区位不相同区域。