量子力学和分子力学组合方法.pdfVIP

第30卷 第2期 摇 摇 大 学 化 学 Vol.30 No.2 摇 2015年4月 UNIVERSITY CHEMISTRY Apr.2015 摇 doi:10.3866/ pku.DXH 量子力学和分子力学组合方法 1* 2 2 谢湖均 摇 雷群芳 摇 方文军 1 2 ( 浙江工商大学应用化学系摇 浙江杭州310035;浙江大学化学系摇 浙江杭州310027) 摇 摇 摘要摇 量子力学和分子力学(QM/ MM)组合方法结合了量子力学的精确性和分子力学的高效性,在研究 凝聚态中的化学反应及生物大分子的结构和活性等方面发挥着重要作用。 本文主要介绍了QM/ MM组合方 法的基本原理及国内外有关QM/ MM组合方法的研究进展。 摇 摇 关键词摇 QM/ MM组合方法摇 多尺度模型摇 酶催化摇 诺贝尔化学奖 摇 摇 中图分类号摇 O64;G64 Combined Quantum Mechanics and Molecular Mechanics 1* 2 2 Xie Hujun 摇 Lei Qunfang 摇 Fang Wenjun ( Department of Applied Chemistry,Zhejiang Gongshang University,Hangzhou310035,Zhejiang,China;1 2Department of Chemistry,Zhejiang University,Hangzhou310027,Zhejiang,China) 摇 摇 Abstract摇 Combined quantum mechanics and molecular mechanics (QM/ MM),which combines the high effi鄄 ciency of quantum mechanicsandtheaccuracyofmolecularmechanics,playsanimportantroleinthestudyofchemi鄄 cal reactions of condensed matter,biological macromolecular structure and activity. Thispaper introducestheprinci鄄 ple and research progresses of combined QM/ MM. 摇 摇 Key Words摇 Combinedquantummechanicsandmolecularmechanics;Multi鄄scalemodel;Enzymaticcatalysis; The Nobel prize in chemistry 摇 摇 2013年诺贝尔化学奖 10 月9 日在瑞典揭晓,法国斯特拉斯堡大学和美国哈佛大学教授 Martin Karplus、美国斯坦福大学医学院教授Michael Levitt和美国南加州大学教授Arieh Warshel 因发展复杂化 [1鄄2] 学系统的多尺度模型而共享奖项 。 以前化学家是用塑料的球和棍来搭建和创造分子模型,而现在则 是用计算机来辅助建模和计算。 分子和化学反应的精确建模对于化学的进步至关重要,化