动力学轨迹VMD转Movie的方法.doc

在安装之前先在电脑上安装一个视频制作软件VideoMach 下载地址 /main/download.php 先把蛋白质载入VMD，再把TRR轨迹载入VMD里， 更改一下试图为ribbons 再点击Extensions ---?Visualization----?Movie Maker，如图所示 在Render 下拉菜单里面选择你需要的渲染工具，默认是screens capture，如果装有Ray tracer的话可以选；Movie setting 里选动画的模式，不用过多解释，一看就明白，一般选择Trajectory，当然你可以可以自己定义；Format 下拉菜单里可以选择AVI或者MPEG-1，默认MPEG-1，AVI太大了；Name of movie??动画的名称，随便设Rotation angle 如果在Movie setting里选择了旋转，角度在这里控制Trajectory step size 每隔多少个frame输出一帧，比如你的轨迹有10万个frame，可以10步输出一帧，也就是1万帧Movie duration 会根据Trajectory step size的设置自行计算设置好了点击 Make Movie实际上vmd就是输入一帧帧的图片，然后你可以通过工具把这些图片整合成一个动画，常用的软件是videomach vmd输出渲染好的图片后就会提示找不到videomach的路径，然后你手动给它指定好路径后，videomach就会自动打开  完成后生成的图片会自动删除（你可以在Movie setting设置不删除），目标目录下会生成一个MPG/AVI的动画，打开就能播放了。