蜡状芽胞杆菌群三大医类全基因组序列的同源性分析.pdfVIP

基因组学与应用牛物学，20lO年，第29卷，第5期，第994—998页 Genomicsand AppliedBiology，2010，V01．29，No．5，994—998 技术改进 Up伊adedTeclulology 蜡状芽胞杆菌群三大类全基因组序列的同源性分析 郭刚t马琪奇z李炫，曾会才P刘正初， 1中国热带农业科学院海口实验站／香蕉研究所，570102，海口；2华中农业大学生命科学技术学院，农业微生物学国家重点实验室，武汉， 430070；3中国农业科学院麻类研究所，长沙，410205 ‘通讯作者，面c08l@126．com 摘要全基因组比对一般采用全基因组范围内的序列比对，本文首次采用单基冈在全基因组范围内进行 10987，＆．E33L和日缸A靴5A耽es￡Dr)全基因组进行横向比对，所有基凶在各个基因组中的排列顺序完全一 致，少有交叉，进一步证明：在蜡状芽胞杆菌群中，特别是在蜡状芽胞杆菌、苏云金芽胞杆菌和炭疽芽胞杆菌 之间，存在相当大的基凶相似性，这与前人的研究结果一致。这种相似性有利于将来用于在该群中所有菌株 的全基因组测序装配中。 关键词蜡状芽胞杆菌群，全基因组，基因组装配 me ofⅥm01e—GenomesofThree B僦以一 Hom0109yAnalysis Speciesamong Z瑚ce陀邯Group 2 1。 Liu 3 Guo Ma “X啪3 Huicai Gang’ Qiqi Zeng Zhengchu of State l Haikou Stati伽／IIlstitIlteofB锄觚a锄dPlalltain，ChineseTropicalA鲥cultIlI℃andScience，Haikou，570102；2K掣 Exp谢m∞taJ Acad咖y of ofLifeSci锄ce锄d Injn细te Laborat0哆ofA鲥cultIlmlMicmbiologyCollegeTecllnology，H岫zllongA鲥cultmlUniversity，WlIll锄，430070；3 BaStFiber Crops，Chine∞AcademyofA鲥cultIIralSci既ces，Changsha，410205 ·Corrcsponding跏tIlor，疝c08l@126．c锄 DOI：lO．3969／gab．029．000994 to thesimil小 atthelevelof scaleisthe method Abstract whole—genomic analysis Sequenceali罂Ⅱnem ordillary difl’erent orderof toeValuatethe ofdifrerent is it)，of genomes．Thearrange singlegene homology gcnoⅡlesfirstly inthis essentialof wereselectedforthe se。 B∞刎w