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如何建数据库
数据库基本概念
主要内容
♦什么是数据库?
♦数据库可以做什么?
♦构建数据库需要做那些工作?
♦如何构建数据库?
♦构建数据库的人员
♦举例
一 什么是数据库
♦资料库?(genebank )
♦有没有结构?(Abstract Syntax Notation
ASN.1 根据什么确定结构?)
谁使用、怎么使用。
♦使用者的角度(不同的使用目的)
♦构建者的角度
♦维护者(数据维护、系统维护DBA )的
角度。
什么是数据库
♦数据库是某个研究领域、研究对象所涉
及的数据的综合。他不仅反映数据本身
的内容,而且反映数据之间的联系。
信息和数据
♦数据库研究的对象是数据及其存储管理。
数字、时间、字符、字符串、结构、对
象。
♦数据是客观世界信息在计算机上的表示
locate、LOCUS 、ACCESSION 、PID 、
DBSOURCE 、ORIGIN
♦信息是什么?
信息是什么?一
♦核酸序列
♦氨基酸序列
♦功能
♦外显子、内含子
(生物医学工作者对其研究领域的理解和
概念,但是计算机如何理解他们?)
信息是什么?二
♦信息就是经过加工后的数据,它对接受者的决
策或行为有现实或潜在的价值。通俗地讲,信
息就是有用的消息。
♦信息是有意义的
信息的接受者。
信息的作用。
信息的处理和加工。
信息的表现形式直接影响信息的被接受程度
(可视化)。
信息是什么?三
♦现实世界的事物反映到人的脑子中来,
人们对这些事物有个认识过程,经过选
择、命名、分类等抽象工作后进入信息
世界。
♦ (数据库)信息世界的概念
实体、属性、码、域、实体型、实体
集
联系。
♦信息是有结构的(分类、聚集、概括)
信息是抽象的结果(舍弃)
♦抽象是有目的的
♦抽象是有舍取的
♦抽象
什么是数据
♦生物医学工作者对其研究领域的理解和
概念,如何能被计算机所理解?
♦计算机中对信息的表示
GeneName:FGFR1 (字符串)
Location:8p12 (字符串)
。。。。。。
如何用数据表达信息及其结构
♦描述系统的静态特性,即组成数据库的
对象类型
♦数据的约束条件是完整性规则的集合,
规定数据库状态及状态变化所应满足的
条件,以保证数据的正确、有效、相容。
例如关系模型中的实体完整性、参照完
整性、用户定义的完整性等。
♦依赖关系表征了属性与属性之间的关系
信息的存储与管理
♦代表信息的数据存储于计算机中
♦按照一定的结构和原则存储
类似于我们在仓库中存放物品
存储
第一步:确定物品分类(规格、型号)
第二步:入库
管理
查找、提取、更新
信息的发布和使用
Web database
数据
信息
处理
发布
二 数据库可以做什么
信息检索
数据共享(应用程序)
决策支持
信息检索
♦查询
根据记录的一组属性值找出相应的记录
并得到需要的信息。
select CommonName
from Protein
where IsMultifunction =true ;
♦查询优化
分析
♦数据挖掘
♦统计分析
♦决策支持
为程序提供数据
♦程序的数据源
♦应用程序更新修改数据库
♦应用程序描述了数据库数据的处理规则
♦在计算机上可运行的生物模型=应用程
序+数据库?
三构建数据库需要做什么
抽象 实现
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