第3课 实验2 序列查询(Entrez)、BLAST序列相似性搜索.pdfVIP

实验二：序列查询(Entrez)、BLAST 序列相似性搜索 实验目的： 1. 学会用Entrez 系统查找目标序列 2. 学会使用BLAST 在数据库中搜索相似序列 3. 学会分析数据库搜索结果 实验内容： 一、Entrez Entrez 是一个由NCBI 创建并维护的基于Web 界面的综合生物信息数据库检索系统。用 户不仅可以方便地检索Genbank 的核酸数据，还可以检索来自Genbank 和其它数据库的蛋白 质序列数据、基因组图谱数据、来自分子模型数据库(MMDB) 的蛋白质三维结构数据、种群 序列数据集、以及由PubMed 获得Medline 的文献数据。 网址： /Entrez/ （或在NCBI 主页默认All Databases 时点击搜 索框右边的Search 进入）。如Figure 2. 1 所示： Figure 2.1 entrez 检索系统子数据库 点击搜索框右边的help 按钮，即可进入Entrez 帮助页面。 在搜索栏输入你要查找的关键词，点击“GO” 即可开始搜索。如果输入多个关键词，它 们之间默认的是“与” （AND ）的关系。 Tips:搜索的关键词可以是一个单词，短语，句子，数据库的