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第十章 多重序列比对 第十章 多重序列比对 　 Vector NTI 的多重序列比对程序和其他的比对软件比较起来非常的方便实用，操 作接口也很简单，比对的结果可以存取和输出。NTI 有两种序列比对程序，一种为 AlignX ，可以用在核酸序列和蛋白质序列比对；另一种为AlignX Blocks ，只能用在蛋 白质序列比对。 　 如何开始进行序列比对？用户可以从程序集开启档案( 图10.1)： 图10.1 由程序集开启AlignX 　 　 　 　 或者是从主程序中开启( 图10.2)： 图10.2 由主程序开启AlignX 　 用户也可以在主程序( 图10.3)具有操作序列的情况下开启AlignX-Align Selected Molecules ，使用者的序列会直接加载到AlignX 中： 图10.3 在操作序列的情况下开启AlignX 的方法 77 Vector NTI 教育训练手册 　 开启AlignX 之后，使用者会见到图10.4 的画面： 图10.4 在操作序列的情况下开启AlignX 首先用户要把序列加载Vector NTI 程序中，可以点选 或者从左上方的Project →Add Files 把序列档案加载，请注意文件名不可以过长，檔名过长会造成程序进行比 对时无法完全显示文件名( 图10.5)： 图10.5 输入的档名注意不可过长 　 选取档案后按下开启就可以加载程序中，若比对的序列很多时可以用鼠标圈选欲 分析的序列后选择开启。序列档案加载的时候程序会询问该序列为核酸序列或是蛋白 质序列，点选好以后再点选Import 就可以了( 图10.6)： 78 第十章 多重序列比对 图10.6 载入时，会询问序列的性质，核酸序列或蛋白质序列 接下来程序的左上方会出现使用者加载的序列( 图10.7)，序列加载完成以后就可 以开始进行比对的操作： 图10.7 成功载入序列的画面 进行比对前，先把欲比对的序列用鼠标进行圈选( 图10.8)： 图10.8 选取欲比对之