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蛋白质一级结构测定意义
蛋白质一级结构测定的 意义 辜国标 梁新元 赵李英 陈东平 卢元峰 罗家勇 蛋白质一级结构的概念 蛋白质的一结构是指蛋白质多肽链中的氨基酸的排列顺序。在基因编码的蛋白质中,这种序列是由mRNA中的核苷酸序列决定的即DNA分子中核苷酸的序列决定的。 蛋白质的一结构是蛋白质最基本的结构。 其表示方法与多肽相同:从左到右,从N-末端写到C-末端,写出组成多肽链的氨基酸的三个字母或单个字母的简写符号,氨基酸残基之间用“-”或 “·”连接。 多肽链中氨基酸之间的连接键主要是肽键(peptide bonde),另外有的还有二硫键(disulfide bond) ,有链间和链内二硫键之分。 二硫键起着稳定空间结构的作用,二硫键越多越称稳定,而且往往与生物活性有关。 核糖核酸酶的一级结构 蛋白质一级结构测定的意义 一:预测蛋白质的二级及三级结构,甚至预测蛋白质某些功能 二:对于研究生物进化提供不可缺少的重要材料 三:研究病变的机理:如分子病 四:对于酶催化部位及高级结构的研究提供化学基础 五:为合成某些生物药类提供依据 六:是研究基因工程中基因表达的重要内容 一:预测蛋白质的二级及三级结构,甚至预测蛋白质某些功能 蛋白质折叠的热力学假说 蛋白质的高级结构由其一级结构决定的学说最初由Christian B. Anfinsen于1954年提出。Anfinsen提出了蛋白质折叠的热力学假说(thermodynamic hypothesis)。根据此假说,一个蛋白质的天然三维构象对应于在生理条件下其所处的热力学最稳定的状态。热力学稳定性由组成的氨基酸残基之间的相互作用决定,于是蛋白质的三维构象直接由它的一级结构决定。 推测蛋白质高级结构。 蛋白质的一级结构可通过多种方法测定。由于二十种氨基酸在几种二级结构中出现的频率是不同的.进而求出每一种氨基敌的构象参数,可以由此预测蛋白质的二级结构。我们进一步从肽键的统计分析出发,指出二肤和三肤的关联频率和二级结构间的相关性,利用二肽和三肽构象参数进行预测,正确率可达90%。但是蛋白质折叠是相当复杂的。且肽链在体外折叠与比在生物体内折叠慢。到现在为止,我们仍然不能根据一个蛋白质的一级结构推断出它的三维结构。 二:对于研究生物进化提供不可缺少的重要材料 研究生物进化。不同生物体的同源蛋白质一级结构在氨基酸组成和顺序上不同,存在种属差异。同源蛋白质一级结构的差异可反映种属间的亲缘关系,但不影响其生物学功能 同源蛋白质? 是指来源于共同原始祖先,在不同种属生物中执行相同功能的蛋白质。 三:研究病变的机理:如分子病 *对于维持蛋白质功能区的特定构象,一级结构中某些氨基酸残基是必需的,如果这些氨基酸残基发生改变,蛋白质的特定构象必将被破坏,蛋白质的生物学活性丧失。 *由于蛋白质分子发生变异所导致的疾病称为分子病。 其根本原因是基因发生变异。 四:对于酶催化部位及高级结构的研究提供化学基础 一级结构决定空间结构,一级结构的改变将使酶的催化功能发生相应的改变。主链的断裂可能使酶的活力保持不变、显示出来或完全丧失。对于酶的前体,通过蛋白酶的作用,使酶分子的主链在特定的位置断裂,从而显示出催化活性。有的蛋白折叠需要分子伴侣等外在帮助。一级结构是高级结构的基础,从这个意义上说高级结构是由一级结构决定。 五:为合成某些生物药类提供依据 六:是研究基因工程中基因表达的重要内容 完 谢谢! * * * HGly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-AsnOH 1 5 10 20 15 A链 7 11 6 21 HPhe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His- Leu-Val- Glu- Ala- Leu- Tyr –Leu -Val-Cys-Gly Glu-Arg-Gly-Phe-Phe-Tyr-Thr-Pro-Lys-AlaOH B链 1 5 7 10 15 19 20 21 25 30 S S —S————S—— S S Sanger(桑格) 同源蛋白一级结构的差异是在漫长的生物进化过程中由于基因突变造成的,是生物进行的遗迹,有人称这为活化石,也可看作分子化石。 同源蛋白质与生物进化:通过同源蛋白质来研究生物进化即:检测各种同源蛋白质中可变残基的变异来研究生物进化 如:镰刀型贫血病血红蛋白 由此引起三级结构多一疏水键,四级结构发生线性缔合,导致红细胞发生溶血,不易透过毛细血管,血流速度减慢。 β-
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