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宏基因组技术在海洋石油污染修复中的应用_0
宏基因组技术在海洋石油污染修复中的应用
第 1 2卷
第 3期
广 东 轻 _ 丁 职 业 技 术 学 院 学 报
J OURN AL OF GUAN GDONG I N DUS T RY T E CHNI C AL C OL L E GE
V0 1 .1 2 No . 3 Se pt .2 01 3
2 0 1 3年 9月
宏基 因组技术在海洋 石油污染修复 中的应用 术
李 静 邓 毛 程 王 文 文 ,
( 1 .广 东 轻 工职 业 技 术 学 院 食 品 与 生 物 工 程 系 , 广东 广州 5 1 0 3 0 0 2 .广 东 高 校 特 色调 味 品 工 程 技 术 开 发 中 心 , 广东 广州 5 1 0 3 0 0 )
摘 要 : 生物 修 复在 海 洋石 油 污 染 治理 中具有 重 要 地位 , 虽然 目前环 境 中可 以培 养 的微
生 物 比例 很低 , 但微 生物 的 基 因资 源十 分 丰 富 , 因 此 借 助 宏 基 因 组 技 术 可 以 克 服 传 统 生
物修 复技 术 中微 生物 资源利 用 不充 分的 问题 , 为利 用 未培 养微 生物 开展 环 境修 复提 供 了 有 效途径 。 本文 要 介 绍 了宏 基 因 组技 术 实施 的 方 式 , 并 结合 海 洋石 油 污 染的 特 点 , 对
该 技 术 的 应 用 现 状 作 了 阐述 。
关键词 : 宏基 因组 ; 石 油 污染 ; 生物修 复
中图 分类 号 : X 5 0 5
文献 标识 码 : A
文 章编号 : 1 6 7 2 . 1 9 5 0 ( 2 0 1 3 ) 0 3 0 0 3 5 - 0 7
方 法 如加入 消 油 剂 、 凝油剂等 , 虽 然 这 些 方 法 可 以 取 得一 定 的除油 效果 , 但仍 普 遍存 在 除 油不 彻 底 和 容 易造 成 二 次 污 染 等 问题 。采 用 生 物 法 进 行 石 油 污 染修 复具 有 处 理 费 用 低 、 治理效果好 、 对 环 境 影
1 9 9 1年 P a c e首 次 提 出 环 境 基 因 组 学 的 概 念 ,
并 构 建 了第 一 个克 隆 环 境样 品 中 D N A的 噬 菌 体文 库, 其 研究 目标 是在 环 境 胁 迫对 机 体 遗 传 变异 的过
程 和机 理 中 , 发掘环境应激和应答基 因的多态性。 1 9 9 8年 ,鉴 于 土 壤 具 备 丰 富 的 微 生 物 资 源 , Ha n d e l m a n … 通过 直 接 提 取 环 境 D N A, 将 不 能 直 接 用 传 统培 养方 法分 离 的 微 生物 的基 因 通 过转 化 、 克 隆到 可培养 微 生物 中 , 从 而 在 克 隆菌 株 上 获取 新 的 生 物 活性 物 质 , 首 次 提 出宏 基 因 组 ( m e t a g e n o mi c s ) 技术的基本 流程。近年 来 , 研 究 人 员 已 构 建 了 土 壤、 海 底淤 泥 、 植物 树 茎 和红 树 林 等 宏 基 因组 文 库 ,
响小 、 无
二 次 污 染 等 优 点 , 逐 渐 吸 引越 来 越 多 的研
究 人员 和工 程技 术人 员深入 开展 研究 。
1 宏 基 因 组 技 术 研 究 概 述
S t r e i t 等 提 出了宏基 因组 技术 的一般 流程 : 环 境 中微生物 D N A的分 离 、 D N A文库 的构 建 、 目的基
并 筛选 到 多种 生 物 活 性 物 质 。该 技 术 避 免 了传 统
微 生 物学 基 于纯培 养 研 究 的 限制 , 为更 加 充 分 地 开 发 利 用未 培养 微生 物 、 并 从 完 整 的群 落 水 平 上认 识
微生 物 的活 动提供 了可 能 。
因的 克隆及 筛选 、 目的基 因的扩 增和 应用 。
1 . 1 样 品 总 DN A 的 提 取
样 品总 D N A 的 提 取 方 法 有 直 接 提 取 法 和 间
接提 取法 两种 。直 接 提 取 法 是 将 样 品直 接 悬 浮 于裂 解缓 冲液 中提 取 , 此 方法 简 便 、 成 本较 低 , 但由
于机 械损 伤较 大 , 因 而 所 获 得 的 片 段 较 小 。 间 接 提
当前 , 随着海上溢油事 件频频 , 海 洋 石 油 污染
对 海 洋 生 态 的 影 响 受 到 越 来 越 广 泛 的关 注 和 重
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