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第七章-数量遗传学-基础资料
第七章 数量遗传学基础 一、质量性状 二、 数量性状 三、 阈性状 第二节 数量性状的遗传特点 一、 多基因假说 (polygene hypothesis) 二、对数量性状的新认识 第三节 数量性状遗传分析的统计学方法 一、 表型值剖分的数学模型 二、 群体基因型的值及其平均数 三、 数量性状基因对数的估计 第四节 遗传参数 一、数量性状方差的剖分 二、重复力(repeatability) 三、遗传力(heritability) 四、遗传相关(genetic correlation) 第五节 数量性状基因座(QTL) 一、概念 二、QTL的检测方法 三、QTL的性质 四、QTL的应用 五、已知几种家畜的QTL 问题: 3.遗传相关的应用 (1)间接选择 利用易度量的性状对不易度量的性状 的遗传相关作间接选择; 利用幼畜某些性状与成畜主要经济性 状的遗传相关作早期选种。 (2)制定性状间有相关时的选择指数 I :选择指数 n :选择性状数 Pn :性状表型值 bi :待定系数 待定系数b的的计算: b=P-1 G w b :待定系数向量 P :表型方差、协方差矩阵 G :遗传方差、协方差矩阵 w :经济权重向量 P-1 :P的逆矩阵 计算这些矩阵所需要的参数: 1、性状的标准差(σP) 2、性状的遗传力 (h2) 3、性状间的表型相关 (rP) 4、性状间的遗传相关 (rA) 5、性状的经济权重 (w) 举例与习题 “通常将这些对数量性状有较大 影响的基因座称为数量性状基因座 (quantitativeTrait locus, QTL),它 是影响数量性状的一个染色体片段, 而不一定是一个单基因座。 ——《普通遗传学》(P.268) “QTL是数量性状基因位点 (Quantitative trait loci)的英文拼写, 是位于染色体上影响数量性状的一些区域,其位置可以通过数量性状与遗传标记的连锁分析来确定。” ——《新编遗传学教程》P.226 “数量性状基因座是指可定位的 遗传标记(通常是可变数目的串联重 复序列),这些标记与影响特定性状 的基因紧密连锁(DNA物理图谱上邻 近)。遗传标记与性状之间的关联可 以用来寻找控制这个性状的基因位置”。 ——《遗传学》 Instant Notes中文版(P.158) 1. 偏离正态分布检验法 2.主基因指数法(Im1) P0 , PSD , PS , PD分别为子女,双亲, 父亲,母亲的表型值。 该公式成立的条件: 1、亲本为两个极端品种; 2、决定数量性状的基因不连锁; 3、无显性,无上位; 4、基因型与环境无互作。 举例: 已知玉米的短穗品种穗长为6.6cm,长穗品种穗长为16.8cm;F1和F2的穗长标准差分别为1.52和2.25,试估计决定穗长的基因对数。 答: 即玉米穗长约受5对基因控制。 1. 遗传方差与环境方差 设 P=G+E (符号定义同前) 则 VP=VG+VE (CovGE=0) 2. 遗传方差的剖分 由于 G=A+D+I 则 VG=VA+VD +VI (CovAD= CovAI = CovDI =0) 3. 环境方差的剖分 由于 E=Eg+Es VE=VEg+VEs (CovEgEs=0) 所以,当各种效应无互作时,它们 的协方差为零,就有 VP=VA+VD+VI+VEg+VEs 或 VP=VA+VR VA:加性方差 VR:剩余值方差 1.概念 (1)数量遗传学概念 表型方差中遗传方差和一般环境方差所占的比率。 Re:重复力 (2)生物统计学概念 性状多次度量值之间的组内相关系数。 MSb:组间均方 MSw:组内均方 k0:样本数不等时的加权平均数 n:组数 k:各组头数 i:1,2,…n 2.计算方法举例 为了便于说明重复力的具体计算方法,这里只取了5 头猪的产仔纪录(表14),在实际工作中,样本应当扩大。 表8-2 由5头母猪的产仔纪录计算产仔数的重复力 ———————————————————————————
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