原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
从CCLE中查找细胞系中基因表达量
从CCLE中查找AML细胞系的基因表达量 从CCLE中查找基因表达量 （1.到broadinstitute的一个子页去下载安装GENE-E. /cancer/software/GENE-E/download.html 由于该软件是java编写的，需要java的一个预安装环境。 从CCLE中查找基因表达量 （2.进入CCLE,选择browse-cell line，之后选择Hist subtype1。选择所要查找的细胞系。（AML） 从CCLE中查找基因表达量 （3.选择download selected annotations 这个下载好的cell line annotation.csv文件将在后面使用到。 从CCLE中查找基因表达量 （4.在搜索栏填写所要查找的基因名 如meis1 从CCLE中查找基因表达量 （5.点击meis1，进入detail page。 从CCLE中查找基因表达量 （5.点击download，下载基因表达量的文件，文件后缀名是.gct. 从CCLE中查找基因表达量 （6.用GENE-E打开下载好的基因表达量的文件，里面有所有细胞系的meis1表达量的比对值。（表达量的值来自于芯片） 从CCLE中查找基因表达量 （7.点击file-annotate columns，选择第一次下载的cell line annotation.csv,出现注解。 从CCLE中查找基因表达量 （8.双击hist subtype1，就能够对筛选的细胞系进行由左到右的从高到低的表达量的排列。 从CCLE中查找基因表达量 （9.点击row profile plot，即能够做出表达量的图。 * *
文档评论（0）