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第一章基因组学绪论

基 因 组 学 (Genomics) 郑海霞 课程简介 基因组研究 基因组的基本结构与功能 基因组遗传图与物理图绘制的原理与方法 DNA测序方法和拼接基因组的策略 对基因组序列诠释的方法进行分析探讨 基因组的功能 基因组的复制与进化 基因组进化的分子基础 基因组进化的模式 分子系统发生学 学习目标与方法 学习目标 掌握基因组学的基本概念、基本原理和基本方法 了解基因组重要研究领域,关注热点问题与发展趋势以及国内外研究现状与进展。 学习方法 学科交叉,融会贯通 发展的学科,不拘泥于书本知识。 考核方法与要求 平时成绩:综述报告20% ,平时成绩10%。 试卷成绩:70% 第一章 绪论 基因及基因组学的发展历史 人类基因组计划 基因组学相关的基本概念 基因组学的分类 一、基因及基因组学的发展历史 遗传因子 孟德尔提出: 生物的遗传性状是通过“遗传因子” (hereditary factor)进行传递的 遗传因子是一些独立的遗传单位 孟德尔把可观察的性状和控制它的内在的遗传因子区分开来 遗传因子作为基因的雏形名词诞生了 基因 1909年,丹麦遗传学家约翰逊在《精密遗传学原理》一书中根据希腊语“给予生命”之义,创造“基因”(gene)一词来代替孟德尔假定的“遗传因子”。从此基因便成为遗传因子的代名词一直沿用至今。 基因结构与功能的探索 基因在哪里? 在孟德尔的成果获得承认后,生物界都知道是遗传因子(即基因)决定了生物的性状。但是,基因究竟在细胞内的什么地方?摩尔根以果蝇为试验对象回答了这一问题,基因在染色体上。 摩尔根在《基因论》中绘制了果蝇基因位置图,首次完成了当时最新的基因概念的描述: 基因是在染色体上呈线性排列的遗传单位,它不仅是决定性状的功能单位,也是一个突变单位和交换单位。 至此,人们对基因概念的理解更加具体和丰富了。 基因的化学本质是什么? 基因的化学本质是核酸而不是蛋白质 基因的结构是什么? 1953年沃森和克里克提出著名的DNA双螺旋分子结构模型。 在20世纪下半叶,随着有关研究手段的改进,对人类基因及其与疾病的关系的研究成为生命科学中最重要的领域之一。 1986年美国约翰·霍普金斯(Johns Hopkins)大学著名人类遗传学家和内科教授麦克库塞克(McKusick)造出了“基因组学”(Genomics)这个名词,意指从基因组水平研究遗传的学科。 不是一个人提出的 人类疾病的“基因论”之说,是人类基因组计划的主要思路 当我们陶醉于以前的科学成就时,却突然发现了人类对自身的认识太少了。 人的生老病死究竟是由什么决定的?我们基本上没办法解答这个问题。更重要的是,人类面对一些疾病,有时显得束手无策,这迫切需要人类去认识了解自身。 背景 20世纪初期,人类发现了生命的基本规律之一遗传规律。 50年代初,英国和美国的科学家提出遗传物质DNA的双螺旋模型。 70年代开始的DNA克隆技术 与此同时,我们还发现,几乎人类所有的疾病和基因有关系。 人类基因组计划—— 解读与生、老、病、死有关的遗传信息(基因)的“四字天书” 总“字”数:30 多亿个 “字 母”: 4个 简介 人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家Renato Dulbecco于1985年率先提出,于1990年正式启动的。 美国、英国、法兰西共和国、德意志联邦共和国、日本和我国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。 这一计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序,发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置,破译人类全部遗传信息。 “人类基因组计划”与“曼哈顿原子弹计划”、“阿波罗登月计划”一起,并称为人类自然科学史上的“三大计划”,是人类文明史上最伟大的科学创举之一。 人类基因组计划是一个合作计划 6个国家的16个中心上千名科学家参加。其中美国占54%的份额,英国占33%,日本占7%,法国约占3%,德国约占2%,中国占1%。每个国家所占的份额同该国的生物产业水平成正比。 为什么选择人类的基因组进行研究? 因为人类是在“进化”历程上最高级的生物,对它的研究有助于认识自身、掌握生老病死规律、疾病的诊断和治疗、了解生命的起源。 在HGP中,还包括对五种生物基因组的研究:大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠,称之为人类的五种“模式生物”。 HGP的最初目标:15年内(1990-2005)投入30亿美元,完成人类24条染色体的30亿个核苷酸序列分析 HGP的终极目标是解码生命、了解生命、认识种属之间和个体之间存在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 竞争与合作 人类基因组计划的进展并不是一帆风顺的。以全球合作、数据共享为主旨的

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