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生物信息学讲义,第六章
原核生物基因组的操纵子与基因群结构 原核生物的基因结构 STOP ATG ATG …CCC TCGAAGC… ATG Transcription Initiation Motif Coding ORF Translation Initiation Motif Upstream region Texts from coding/noncoding regions in DNA sequence GTGAGGGATCGTGGGCATATTTCACAAACTTACTTTTAAAACCATACAACGAAGAAGCGGCCATAATGAACGACTCTTTACAGAATACGGATCTCATTTCACACTTCTCACATCCATTTTAG TTGGAAACACATGAAAGTGAGACCATCAGTTAAACCAATCTGCGAAAAATGTAAAGTTATTTCGCAGAAAAGGAAAAGTAATGGTGATCTGTGAAAATCCAAAGCATAAACAAAAACAAGGATAA GGTTATATAAATGAAAAGATTTCTGATTGGCGCAGGCGTCGCAGCGGTGATTTTATCAGGTTTGGTTTATTGCGGACCATCAAACCCACTCACAGGAAATGAAAGTCGCTGAGAAAATGATTGGATAA GAGATTATTGATGAAAATCAGCCGGATTCTATTGGCAGCAGTGATTTTAAGTAGTGTATTTTTCAATAACTTATTTGCAAAGTGATCATAATACTGAAATTAAAGTTGCTGCAGATCGGGTAGGGGCATAG GTGAGTTTGTATGAAATTGAAGTCTAAACTATTACTCTCTTGTCTGGCTCTAAGCACTGTGGTTCGTGGCAACAACTATTGCAAATGCACCTACACACCAAATTGAAGTTGCACAACGAGGAATGATTTAA AGCCCTCTCGATGGAAAAGATCCCTTGCTTCGCGGAGGAATTGATTATAGGCCTCTCTATCCTGGGGCCGCAAATATTCAAAGTCGAAATGAATGTCACGGAAGCCATATCTTCTGGCATTCTCGACTAG CACGGGACATATGATGGCTTGCAGGTCTTTTAAAGAGACAGCGGCGGTTTGTGACAAGTCAATCAGAAATCCTTCACCCGAGCGCTGCCGGCTGTTCATTTTCCGAAATGCTTCTATGTCTTTTTCATTCTGA CGCCTGAAATATGGTCCGCGTGAAGATGTGTATCAAATACGTGAGTAATCGTTGCACCCTTCCCCTTCGCAAAATCTATAAAGAAATTCACCATACGTGTCGCATCAATAATTGCTGCTTCACCATTTGA AAAGCCAAAAATGATCGACACAGCTATGAAATCGGAGAAGAAATCATGCTTCCGAGTGAAACACGCATGGGCAGAAGGGCCAGCTTTTTTGATTTTTTTAAACTGCGCCCTTTCAAAATGGGGATTTTGA TATATGTAATATGTATGAATTCTTGATTGATGATCGTATCATCAGTTATTTCAATTGCCTCAACGTCAAACTCTTGTTGCAGCGCTTTGACAAACCTTTTTACATTTCCTGTTTTACTCTCATATGTAATTAA CAATGTCCCTATGAAAATACTGCCCTCTGTCCCGATCACCTCCGCCCGGATGTCATGTCCGTATGGAGAGGTTCTGCTTGCCTCGACGTCCCCCGCTGCGCCCGAGTCAAATTCAATATACGTCAGCTGA Start codon Stop codon ATG GTG TTG TAA TAG TGA Protein coding genes Noncoding sequences 原核生物基因组研究的主要方法 1、原核基因组的测序 获得所研究生物的全基因组DNA序列 测序方法：链终止法。 一次测序反映只能测几百个碱基对。 序列的拼接方法。 2、原核基因组的序列解读 通过结合计算机分析、试验验证等手段，初步定位基因及其调控区并阐明基因的功能。 发展原核基因组的基因及其功能识别算法是基因组的计算机分析的重要目标。 当前著名的原核基因预测软件 1、GeneMark系列软件（包括最新版本Gene
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