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- 2017-09-03 发布于天津
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13核酸的非放射性标记和高灵敏度检测 - 北京美莱博医学科技有限公司
Hyb高效杂交液在开始操作之前,请认真阅读整个操作方法。Hyb高效杂交液在室温低于℃时,可能会产生沉淀。如果产生沉淀,可在℃加热、搅动使沉淀完全溶解。℃保存。
核酸杂交是一种应用于基因结构和表达分析、基因组研究和临床诊断的常规技术。技术的成功依赖于影响探针与靶序列结合的一系列因素,包括:杂交温度、探针浓度、离子强度、pH及杂交液的粘度等。
Hyb高效杂交液是经优化的适合在正电荷尼龙膜上进行Northern和Southern杂交分析的杂交液,典型的膜杂交需要长时间的孵育并且实验条件难于优化。而Hyb高效杂交液的独特配方和操作规程可有效地消除这些困难。Hyb高效杂交液仅需要杂交小时,而常规杂交则需要1224 小时。它也能明显地降低非放射性检测的背景。以使Northern膜上的低拷贝RNA和Southern膜上的单拷贝基因得以检出。
Hyb高效杂交液也适于各类cDNA表达芯片等。Hyb高效杂交液可用于探针的放射性和非放射性标记,并且在杂交后运用放射性和化学发光检测系统(如地高标记的探针)可得到相当的结果。
下图简要说明了放射性和非放射性标记的探针的杂交过程。
放射性标记的探针 非放射性标记的探针
一、cDNA 探针杂交【概论】
Hyb高效杂交液可用于Southern、Northern或菌落杂交。唯一不同的是杂交温度的差异。Northern和菌落杂交为℃。Southern杂交为℃。
本方法中所采用的杂交温度,适用于平均G/C含量(40%)的DNA探针的杂交。
对于G/C含量不同的探针的最适杂交温度,则必须通过试验才能确定,具体计算公式请参照附录。
建议Southern/Northern杂交时使用的cDNA探针浓度为2~10 ng/ml或1~2×106cpm/ml。(探针浓度大于10 ng/ml时虽可缩短杂交所需时间,但可能会加深背景)。菌落杂交时的探针浓度为100ng/ml。
高浓度探针不能直接加到膜上,因为局部探针浓度不均一会导致产生异常杂交信号。
【放射性标记的cDNA探针杂交】
在℃加热Hyb杂交液,充分搅动以彻底溶解沉淀。
在10×10 cm的膜上至少加入5ml杂交液,确保整块膜都能被杂交液覆盖,排除所有气泡,在℃连续振荡30分钟,进行预杂交。
将放射性标记的cDNA探针置于℃水浴中煮5分钟使之变性,然后迅速放在冰浴中冷却。
将放射性标记的探针加入到5 ml新鲜杂交液中,充分混匀。
去除预杂交溶液,加入预热的含放射性探针的杂交液,排除气泡,确保杂交液均匀地分布在整个膜上。
在℃连续振荡杂交2-6小时或更长时间(可以杂交过夜),视探针浓度而定。
在室温下用洗涤液I振荡洗膜2(15分钟。
在℃、洗涤液II中振荡洗涤30分钟,期间更换洗涤液一次。
用镊子将膜取出,滴去膜上多余的洗涤液。注意:不能让膜干燥,那怕部分变干也不行,否则以后很难脱除膜上的探针。
立即用塑料薄膜(保鲜膜)将膜覆盖,用胶纸固定在3 mm滤纸上,再用塑料薄膜包裹。
在℃,用2块增感屏进行X光胶片曝光。
【非放射性标记的cDNA探针杂交】
在℃加热Hyb杂交液,充分搅动使沉淀完全溶解。
在10×10 cm膜中至少加入5ml杂交液,使膜完全被杂交液覆盖,排除气泡,在℃连续振荡60分钟,进行预杂交。
将非放射性标记的探针在℃水浴中煮5分钟使之变性,然后迅速放入冰浴中冷却。
将变性的探针加入到5 ml新鲜杂交液中,充分混匀。
除去预杂交溶液,加入预热的含标记探针的杂交液,排除气泡,确保整块膜都被杂交液均匀浸润。
在℃连续振荡杂交2-6小时或更长时间(可以杂交过夜)。
在室温下,用洗涤液III将杂交好的膜振荡洗涤2次,每次30分钟,并更换洗涤液。每100cm2膜至少用20 ml洗涤溶液洗涤。
在℃,用洗涤液II将膜振荡洗涤2次,每次30分钟,并更换洗涤液。注意:对于与靶基因不是完全同源的探针来说,这一步的洗涤温度需降低至℃进行洗涤。
用镊子将膜取出,滴去多余的洗涤液。
膜直接进行酶联免疫显色或化学发光检测。注意:操作期间不能让膜干燥,否则很难脱除探针。二、寡聚核苷酸探针杂交建议杂交时使用的寡聚核苷酸探针的浓度为20~50 ng/ml或1~2×107 cpm/ml,探针的浓度大于50 ng/ml虽可缩短杂交所需时间,但可能会加深背景。
【放射性标记的寡聚核苷酸探针杂交】所有步骤与放射性标记的cDNA探针杂交步骤相同,但是预杂交和杂交温度为℃,洗膜温度均为室温。【非放射性标记的寡聚核苷酸探针杂交】
在℃中加热HyB杂交液,充分搅动使沉淀完全溶解,然后平衡至℃备用。
在10×10 cm膜中至少加入5 ml杂交液,排除气泡,确保膜为杂交液覆盖,在℃预杂
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