植物DNA条形码研究进展摘要.pdf

生物多样性 2008, 16 (5): 417–425 doi: 10.3724/SP.J.1003.2008.08215 Biodiversity Science http: // 植物DNA条形码研究进展 宁淑萍1, 3 颜海飞1 郝 刚2 葛学军1* 1 (中国科学院华南植物园, 广州 510650) 2 (华南农业大学生命科学学院, 广州 510642) 3 (中国科学院研究生院, 北京 100049) 摘要: DNA条形码(DNA barcoding) 已成为近5年来国际上生物多样性研究的热点, 即通过使用短的标准DNA片段, 对物种进行快速、准确的识别和鉴定。该技术在动物研究中已得到广泛的应用, 所采用的标准片段是线粒体COI 基因中约650 bp长的一段。然而在植物中DNA条形码的研究进展相对缓慢, 目前尚处于对所提议的各片段比较和 评价阶段, 还未获得一致的标准片段。由于植物中线粒体基因组进化速率较慢, 因此条形码片段主要在叶绿体基 因组上进行选择, 被提议的编码基因片段主要有rpoB, rpoC1, matK, rbcL, UPA, 非编码区片段有trnH-psbA, atpF-atpH, psbK-psbI , 此外还有核基因ITS 。已有的研究表明以上任何一个单片段都不足以区分所有植物物种, 因 而不同的研究组相继提出了不同的片段组合方案, 目前被广泛讨论的组合主要有5种。本文综述了DNA条形码序 列的优点、标准、工作流程、分析方法和存在的争议, 重点论述了植物条形码研究中被提议的各序列片段和组合 的研究现状。 关键词: DNA条形码, 物种识别, 分析方法, 条形码评价 Current advances of DNA barcoding study in plants 1, 3 1 2 1* Shuping Ning , Haifei Yan , Gang Hao , Xuejun Ge 1 South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510650 2 College of Life Sciences, South China Agricultural University, Guangzhou 510642 3 Graduate University of the Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049 Abstract: DNA barcoding has become one of hotspots of biodiversity research in the last five years. It is a method of rapid and accurate species identification and recognition using a short, standardiz