高等植物DNA条形码最新研究进展及其应用.PDF

核 农 学 报　 ２０１６，３０（５）：０８８７ ～０８９６ ８８７ 　 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＮｕｃｌｅａｒＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 文章编号：１０００⁃８５５１（２０１６）０５⁃０８８７⁃１０ 高等植物 ＤＮＡ条形码最新研究进展及其应用 １ １ ２ １ ３ ３ 付　 涛　 王志龙　 钱萍仙　 李　 文　 袁冬明　 严春风 １ ２ （ 宁波城市职业技术学院，浙江 宁波　 ３１５５０２； 浙江万里学院生物与环境学院，浙江 宁波　 ３１５１００； ３宁波市鄞州区林业技术管理服务站，浙江 宁波　 ３１５１００） 摘　 要：植物ＤＮＡ 条形码的筛选工作主要集中于叶绿体基因上，包括位于编码区的ｍａｔＫ、ｒｂｃＬ、ＵＰＡ、 ｒｐｏＢ、ｒｐｏＣ１、ａｃｃＤ、ｎｄｈＪ 和 ＹＣＦ５ 等以及间隔区的ｔｒｎＨ⁃ｐｓｂＡ、ｔｒｎＬ⁃ｔｒｎＦ、ａｔｐＦ⁃ａｔｐＨ、ｔｒｎＤ⁃ ｔｒｎＹ和ｐｓｂＫ⁃ｐｓｂＩ 等，其中ｍａｔＫ、ｒｂｃＬ 和ｔｒｎＨ⁃ｐｓｂＡ 研究最为成熟，可作为核心条形码序列。 由于每个基因进化速率不同以 及植物种间杂交较为频繁等诸多原因，不同类群植物的最适条形码序列有很大差别。 本文综述了ＤＮＡ 条形码的最新研究进展以及条形码技术在物种鉴定、分类学问题修订、新种隐种的发现、植物药材真伪 鉴定、食品质量控制和安全、出入境植物检验检疫等方面的应用，提出了ｃｐＤＮＡ条形码在应用中的不足 之处以及解决措施等，并对ＤＮＡ条形码未来的发展进行了展望，以期为高等植物的应用提供强有力的 分子依据。 关键词：高等植物；叶绿体基因；ＤＮＡ条形码；条形码应用 ＤＯＩ：１０１１８６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１００⁃８５５１２０１６０５．０８８７ ［１］ 　 　 ２００３年动物学家Ｈｅｂｅｒｔ等 首次明确提出ＤＮＡ 记就可能会得出错误结果。 以上因素均使植物在遗传 条形码概念，即利用１个或几个短ＤＮＡ片段对地球上 进化和不同基因组遗传变异上变得更加复杂，而理想 现有的物种进行快速、准确识别和鉴定。 目前，线粒体 ＤＮＡ条形码在短序列片段内对种间和种内的遗传变 基因细胞色素 Ｃ 氧化酶亚基 Ｉ （ＣＯＩ）已被广泛应用于 异有一定的要求。 动物的物种识别和鉴定，成为动物的通用 ＤＮＡ 条形 长期以来，植物 ＤＮＡ 条形码多选用叶绿体上的 码［１－４］。 但由于线粒体基因（包括 ＣＯＩ 基因）进化速 ＤＮＡ序列片段（如 ｍａｔＫ、ｒｂｃＬ、ｔｒｎＨ⁃ｐｓｂＡ、ｒｐｏＣ１、ｒｐｏＢ、 率慢，并不适合作为植物通用条形码的选择区域，至今 ａｃｃＤ、ｙＣＦ５ 和ｎｈｄＪ 等）及其不同片段组合。 近年来， 还未找到类似 ＣＯＩ 的植物“通用标记”，这主要因为： 不同的学者提出了不同叶绿体序列片段组合作为整个 ［４］ １）同一基因在不同植物类群的进化速率不同；２）植物 陆地植物鉴定的ＤＮＡ 条形码。 如 Ｋｒｅｓｓ 等 提出的 ［５］ 种类繁多且倍性复杂。 据不完全统计，目前全世界约 ｒｂｃＬ ＋ ｔｒ