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　　系统生物学方法在中医药研究中的运用论文 【摘要】 系统生物学作为21世纪的一门新兴科学，其研究方法和研究思路与传统的中医学有很多相似之处。运用系统生物学方法有助于揭示中医证候的科学内涵和开展中药现代化研究。系统生物学的技术平台为组学，其中蛋白质组学为明确中医证候的本质和中药复方的作用提供了实验方法；相对于基因组学以及蛋白质组学等分子生物学手段来说，代谢组学更加直接、快速和简便，特别是为中医药防治肾脏疾病的研究提供了有效的方法。 【关键词】 系统生物学; 证候; 中医现代化; 蛋白质组学 Abstract: Systems biology is a nebles traditional Chinese medicine (TCM) in many aspects such as study method and design. Adoption of systems biology approach uch help for exploring the scientific connotation of TCM syndrome and the modernization of Chinese herbal medicine. Its technological platforms, such as genomics, proteomics and metabonomics, provide poe and the function of herbal pound recipe. pared olecular biological methods, such as genomics and proteomics, metabonomics method is more direct and more concise, especially for providing an effective method for the study of TCM therapy in preventing and treating kidney diseases. Keys biology; syndrome plex; modernization (traditional Chinese medicine); proteomics 21世纪中医药现代化研究面临新的挑战。随着人类基因组计划的完成和后基因组时代的到来，生命科学发生了本质的飞跃，为中医药现代化发展提供了新的契机。应运而生的系统生物学与中医药研究的思路和方法不谋而合，为复杂的中医证候学说和方药体系研究带来了希望。中医中药在我国已有二千多年的发展历史.freels biology），又译为“系统集成生物学”或“系统综合生物学”，是近年来继人类基因组计划之后，科学界关注的又一个研究热点。2003年9月，美国哈佛大学医学院开设了20年来该院第一个新系，关注的焦点就是系统生物学［3］。2005年6月，中国科技大学与中国科学院合作成立了国内第一个基于理论科学和实验研究的系统生物学系，将生物学、数学和工程学整合起来融入医学研究领域。随着功能基因组时代的到来，系统生物学已成为医学研究的一个极其重要的工具［4］。它的技术平台为组学，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、相互作用组学、表型组学和计算机生物学等［5］。 1.1 系统生物学有助于揭示中医证候的科学内涵 目前中医证候研究的关键问题在于如何应用现代科学技术开辟一条新的途径，这一途径应既能符合“实体结构”原则，揭示证这一病理产物的物质实体，又能遵循“功能模拟”原则，探索其外在和潜在的表现规律［6］。近年来系统生物学及相关技术的快速发展，为我们从多学科、多视角进一步认识中医证的本质提供了重要的方法学基础和技术条件。通过基因组学研究，建立不同证候类型的基因变异及基因表达差异谱和功能基因调控网络；再通过不同证候类型的差异蛋白质组学和关键的功能蛋白质的鉴定及定量研究，结合中医理论，则有可能从多个层次阐明中医辨证论治的科学内涵，同时也可能发现与证候相对应的特异性基因和功能蛋白标志物，为临床辨证提供客观依据。 例如，王米渠等［7］用基因芯片方法研究中医寒证患者，发现寒证的基因表达谱有显著差异，在59条差异表达基因中，绝大多数与代谢（能量代谢、蛋白质代谢等）有关，说明寒证患者的代谢网络有别于常人，使寒证诊断客观化、现代化成为可能。Chen等［8］采用代谢组学研究发现，肾阳虚模型动物的代谢网络明显偏离正常动物，而用温阳中药干预后，模型动物的代谢谱回归至正常范围，呈现网络修复的结果。 1.2 系统生物学有助于开展中药现代化研究 中药作为一个复合体系，多是配方使用，作用靶点多，涉及多个基因和细胞，从整体上调节人体的平衡和内环境的稳定。