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动物生物化学1蛋白质的结构与功能

第二章 蛋白质的结构与功能; 蛋白质在生命活动中的重要作用 蛋白质的化学组成 蛋白质的分子结构 多肽、蛋白质结构与功能的关系 蛋白质的物理化学性质和分离与鉴定 ;第一节 蛋白质在生命活动中的作用 ;二、蛋白质的分类;;;第二节 蛋白质的化学组成;一、蛋白质的元素组成;二、构成蛋白质的基本结构单位 ---氨基酸(Amino Acid);(二)氨基酸的分类;(2)组成蛋白质的20种氨基酸;(四)氨基酸的主要理化性质;2.氨基酸的两性解离与等电点;第三节 蛋白质的化学结构;一、肽键(peptide bond)和肽(peptide);多肽(polypeptide)和多肽链(polypeptide chain);二、蛋白质的一级结构;胰岛素的一级结构;第四节 蛋白质的高级结构;一、蛋白质结构的层次 ;二、肽单位平面结构和二面角;肽平面(peptide plane):肽链主链的肽键C-N具有双键的性质,因而不能自由的旋转,使连接在肽键上的六个原子共处于一个平面上,此平面称为肽平面。 ;(二)两面角(dihedral angle) 在多肽链里,Cα碳原子刚好位于互相连接的两个肽平面的交线上。Cα碳原子上的Cα-N和Cα-C都是单键,可以绕键轴旋转,其中以Cα-N旋转的角度称为ф,而以Cα-C旋转的角度称为ψ,这就是α-碳原子上的一对二面角。 ;三、维持蛋白质分子构象的化学键 ;四 二级结构 (secondary structure);1 、α-螺旋(α-helix) ;典型的α-螺旋的结构是: 1)外观似棒状,肽链的主链绕Cα相继旋转一定角度,形成紧密的螺旋,侧链伸向外侧 2)每3.6个氨基酸残基上升一圈,每个氨基酸残基绕轴旋转1000,每圈使轴上升0.54nm(0.15nm/氨基酸残基)。这种典型的α-螺旋简写为3.613。 3)每一个氨基酸残基上的亚氨基氢(N-H)与前面第四个氨基酸残基上的羰基氧(C=O)之间形成链内氢键。在氢键封闭的环内,有13个原子-CO-[-N- Cα-C-]3-NH-。 4)大多数天然蛋白质都是右手α-螺旋;2、β-折叠( β- sheet);3、β-转角(β-turn);无规卷曲(random coil) 指蛋白质的肽链中没有确定规律性的那部分肽段构象。它的结构比较松散。这种结构和α-螺旋、β-折叠、β-转角比较起来是不规则的,但对于一些蛋白质分子来讲,特定的无规卷曲构象是不能被破坏的,否则就失去活性。;五、超二级结构(super secondary structure) ;六、结构域(domain);七、三级结构;八、四级结构;第五节 多肽、蛋白质结构与功能的关系;一、一级结构与功能的关系;3、一级结构反映物种的进化---分子进化 ;4、一级结构改变引起分子病;二、高级结构与功能的关系;牛胰Rnase的可逆变性;蛋白质的复性(renaturation) 变性了的蛋白质在一定的条件下可以重键其天然构象,恢复其生物活性的现象。如牛胰RNase;二) 蛋白质的变构与血红蛋白的输氧功能 变构作用(allosteric effect )是指对于多亚基的蛋白质或酶,效应剂作用于某个亚基,引发其构象改变,继而引起其他亚基构象的改变,导致蛋白质或酶的生物活性的变化。 这样的效应剂也称变构剂。;氧合可以引发维系血红蛋白4个亚基的8对离子键相继断开,从比较紧凑的T构象转变为比较松弛的R构象;由两者的氧合动力学比较可见,血红蛋白输氧具有优势

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