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实验室常用分子生物学合集--精华版
一 细菌相关实验技术
1. 细菌分离鉴定
1.1沙门氏菌分离鉴定
1.1.1 食品样前增菌
取检样25g,加入225mL缓冲蛋白胨水于均质杯内。用均质器以8000-10000r/min打碎1min,于36±1培养4h(干蛋品培养18~24h),取 10mL于100mL亚硒酸盐肮氨酸(SC)增菌液内,于36±1培养18~24h。
1.1.2 食品样细菌分离
取增菌液1环,划线接种于DHL琼脂平板,于36±1分别培养18~24h(DHL)或40~48h(BS),观察平板上生长的菌落,沙门氏菌、、、、和沙门氏菌在各个平板上的菌落特征见表1。
非食品样直接取棉拭子在DHL琼脂平板上划线即可。表1 沙门氏菌属各群在各种选择性琼脂平板上的菌落特征
选择性琼脂平板 沙门氏菌、、、、 沙门氏菌(即亚利桑那菌) DHL琼脂 无色半透明;产硫化氢菌落中心带黑色或几乎全黑色 乳糖迟缓阳性或阴性的菌株与沙门氏菌、、、、相同;乳糖阳性的菌株为粉红色,中心带黑色 a) 生化试验: 自选择性琼脂平板上直接挑取数个可疑菌落,分别接种三糖铁琼脂。在三糖铁琼脂内,肠杆菌科常见属种的反应结果见表2。
表2 肠杆菌科各属在三糖铁琼脂内的反应结果
斜面 底层 产气 硫化氢 可能的菌属和种 - + +/- + 沙门氏菌属、弗劳地氏柠檬酸杆菌、变形杆菌属、缓慢爱德华氏菌 + + +/- + 沙门氏菌、弗劳地氏柠檬酸杆菌、普通变形杆菌 - + + - 沙门氏菌属、大肠埃希氏菌、蜂窝哈夫尼亚菌、摩根氏菌、普罗菲登斯菌属 - + - - 伤寒沙门氏菌、鸡沙门氏菌、志贺氏菌属、大肠埃希氏菌、蜂窝哈夫尼亚菌、摩根氏菌、普罗菲登斯菌属 + + +/- - 大肠埃希氏菌、肠杆菌属、克雷伯氏菌属、沙雷氏菌属、弗劳地氏柠檬酸杆菌 说明:在三糖铁琼脂内只有斜面产酸并同时硫化氢(H2S)阴性的菌株可以排除,其他的反应结果均有沙门氏菌的可能,同时也均有不是沙门氏菌的可能。
在接种三糖铁琼脂的同时,再接种碱性蛋白胨水(供做靛基质试验)、尿素琼脂(pH7.2)、氰化钾(KCN)培养基和赖氨酸脱竣酶试验培养基及对照培养基各1管,于36±1培养18~24h,必要时可延长至48h,按表3判定结果。按反应序号分类,沙门氏菌属的结果应属于A1、A2和B1,其他5种反应结果均可以排除。表3 肠杆菌科各属生化反应初步鉴别表-1
反应序号 硫化氢 靛基质 尿素 氰化钾 赖氨酸 判定菌属 A1 + - - - + 沙门氏菌属 A2 + + - - + 沙门氏菌属(少见)缓慢爱德华氏菌 A3 + - + + - 弗劳地氏柠檬酸杆菌、奇异变形杆菌 A4 + + + + - 普通变形杆菌 B1 -
- -
- -
- -
- +
- 沙门氏菌属、大肠埃希氏菌、甲型伤寒沙门氏菌、鸡沙门氏菌、志贺氏菌属 B2 -
- +
+ -
- -
- +
- 大肠埃希氏菌、志贺氏菌属 B3 -
- -
- +/-
+ +
+ +
- 克雷伯氏菌族各属阴沟肠杆菌、弗劳地氏柠檬酸杆菌 B4 - + +/- + - 摩根氏菌、普罗菲登斯菌属 反应序号A1:典型反应判定为沙门氏菌属。如尿素、KCN和赖氨酸3项中有1项异常,按表4可判定为沙门氏菌。如有2项异常,则按A3判定为弗劳地氏柠檬酸杆菌。表4肠杆菌科各属生化反应初步鉴别表-2
尿素 氰化钾 赖氨酸 判定结果 -
-
+ -
+
- -
+
+ 甲型副伤寒沙门氏菌(要求血清学鉴定结果)
沙门氏菌或(要求符合本群生化特性)
沙门氏菌个别变体(要求血清学鉴定结果) 反应序号A2:补做甘露醇和山梨醇试验,按表5判定结果。
表5肠杆菌科各属生化反应初步鉴别表-3
甘露醇 山梨醇 判定结果 +
- +
- 沙门氏菌靛基质阳性变体(要求血清学鉴定结果)
缓慢爱德华氏菌 反应序号B1:补做ONPG。ONPG(+)为大肠埃希氏菌,ONPG(-)为沙门氏菌。同时,沙门氏菌应为赖氨酸(+),但甲型副伤寒沙门氏菌为赖氨酸(-)。
1.1.3 沙门氏菌PCR方法鉴定
a) 煮沸法提取基因组DNA模板
b) 引物设计
fliC-1: 5’-GGCTATTATGAAGTTTCCGTTG-3’
fliC-2: 5’-GGGCAGAAGTCAGGTTGTTTAC-3’
sefA-1: 5’-AATTGTGCGAATGCTAATAGTTG-3’
sefA-2: 5’-TGATACTGCTGAACGTAGAAGGTC-3’
c) 反应体系:单重和二重PCR体系的总体积均为30mL,其中包括:1×PCR反应缓冲液,dNTP 0.2mmol/L,引物各25 pmol/L,1.5U Taq plus聚合酶,3uL DNA模板。
d) 扩增条件:优化后的PCR反应程序为 94预变性5mi
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