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蛋白质－核酸对接方法研究进展-现代生物医学进展
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现代生物医学进展 Progress in Modern Biomedicine Vol.12 NO.5 FEB.2012 · ·
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蛋白质 核酸对接方法研究进展
1 1 2 1△
刘董敏 常 珊 胡建平 田绪红
(1 5106422 614004)
华南农业大学信息学院 广东广州 ；乐山师范学院化学与生命科学学院四川乐山
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摘要：分子对接技术作为预测蛋白质 核酸复合物结构的有效方法，为研究在生物学过程中蛋白质 核酸的相互作用提供了重要
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的工具。本文首先分析了当前蛋白质 核酸对接研究中的主要困难，例如构象变化和核糖磷酸骨架的带电性问题。然后从构象搜
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索、打分函数、柔性策略三个方面比较和总结了蛋白质 核酸对接中主要的计算方法。最后回顾了蛋白质 核酸对接计算模型的
应用，并对未来的工作进行了展望。
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关键词：蛋白质 核酸对接；构象搜索；打分函数；柔性对接
Q615Q75 A 1673-6273201205-979-05
中图分类号： ， 文献标识码： 文章编号： （ ）
1 1 2 1△
LIUDong-min,CHANGShan,HUJian-ping,TIANXu-hong
(1CollegeofInformatics,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510642,China;
2CollegeofChemistryandLifeScience,LeshanTeachersCollege,SichuanLeshan614000,China)
ABSTRACT:
theprospectsofthefuturestudyweremade.
Keywords:
ChineseLibraryClassification(CLC):Q615Q75 Documentcode:A
，
ArticleID:1673-6273201205-979-05
（ ）
展要落后许多，它的主要困难在于：第一，缺乏蛋白质的氨基
前言
[8] -
酸和核酸的碱基对之间有关识别模式的信息 。在蛋白质 蛋
蛋白质和核酸是构成生命体最为重要的两类生物大分子， 白质对接中，对接双方作用面上的大量信息可以引导对接并且
蛋白质与核酸的相互作用是许多细胞功能的核心，它在基因表 [9]
限制构象空间的搜索 。然而到现在为止，核酸在对接过程中作
达调控、蛋白质翻译和细胞分裂等细胞过程中发挥着极其重要 DNA RNA
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