第四章 用18S+rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育.pdfVIP

第四章 用18S+rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育.pdf

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V01.24 第24卷第1期 大连水产学院学报 No.1 200 OFDALIAN 9年2月 JOURNAL FISHERIESUNIVERSITY Feb.2009 ·研究简报· 用18S rRNA序列探讨8种绿藻分子系统发育 张耀东,沈颂东,林阿朋,张劲 (苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州215123) 摘要:测定了宽礁膜Monostromalatissimum、浒苔Enteromorphaprolifera、孔石莼Vivapertusa的18SrRNA基 因序列,并与肠浒苔Eintestinalis、穿孔石莼U乃r淞删口、石莼ulactuca、礁膜胍nitidum和格氏礁膜 Monostroma grevillei5种已知的大型海洋绿藻的同一基因序列合并迸行比较,分析了核苷酸序列差异和碱基 替换特点,并构建系统发生树。结果表明:浒苔与肠浒苔之间的Kimura双参数距离大于浒苔与石莼属3个 物种之间的Kimura双参数距离;用UPGMA法和MP法构建的系统树基本一致,在构建的系统发生树中, 浒苔与石莼属物种聚为一类,表现班与石莼属物种更近的亲缘关系。 关键词:石莼属;浒苔属;礁膜属;18SrRNA;序列变异;系统发育 中图分类号:Q789 文献标志码:A 目前,国外有学者用18SrRNA基因对有关绿prolifera和宽礁膜Monostroma 藻系统学进行研究。如Hayden等…对石莼科各个年下半年采自山东青岛海区。用蒸馏水仔细清洗新 属编码叶绿体RUBISCO大亚基基因和rDNA小亚 鲜藻体,洗去泥沙和其他附着物,然后晾干,一20 基基因的序列进行比较研究,结果表明,石莼属和 ℃下保存,随取随用。 浒苔属是相近的,但不是单一起源的类群。Biota— 1.2 DNA的提取 ster等【2J对浒苔属的两个假定物种进行了序列对比 将冷冻样品进行恢复培养和消毒处理,再切成 nmscoides 研究,建议将同一起源的Entermopha 小的碎片,放入2mol/L的葡萄糖和体积分数为 et (ClementeRubio)Cremades和Enteromorpha l%的海螺酶液中,在25℃下酶解3h。将解离的 clath;rata Roth(Greville)归并成一个种。但国内利 绿藻细胞用筛绢过滤,用离心机沉淀分离细胞和原 用18S rRNA序列进行绿藻系统分析尚未见报道。 生质体。用去离子水反复洗涤离心,以彻底去除酶 大型海洋绿藻主要包括石莼目、礁膜科的礁膜 mL 液。将沉淀转移至1.5mL离心管中,加入500 属Monostroma以及石莼科的石莼属Ulva和浒苔属 mmol/LTris

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