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一种模拟创新的思路—— 环系转换(ring
环系转换(Ring Transformations)——基于构效关系的变换思路
主讲人:刘营营
资料查找:黎献桦
PPT制作:谢虞清
·何为环系转换?
·研究环系转换有何意义?
所谓的环系转化,即是当活性分子含有环状体系时,环状结构可以被打开、扩大、缩小,也可以有其他多种修饰方式,甚至删除。相反,非环状体系可以关环、连接或包含在环状体系中。
先导化合物
首创药物
模拟创新/优化
………..
分子变换
对环系进行修饰——环链转换、缩环扩环、重组环系等方法是设计新型的药物类似物和阐明药物-受体相互作用的高效方法。因此,系统的总结环系转换的基本思路,有助于在模拟创新和先导化合物优化中提高衍生物结构的筛选效率。
·何为环系转换?
·研究环系转换有何意义?
一、模拟法(analogical)
二、剖裂法(disjunctive)
三、拼接法(conjunctive)
环系转换的三种基本思路:
一、模拟法(analogical)
不影响环状体系的整体复杂性,通常得到与母体化合物非常接近的类似物(me-too化合物)。包含环链转换,环缩小或扩大和其他的环转换。
1.开环模拟(analogy by ring opening):
设计合成环状活性分子的开环类似物。
2.关环模拟(analogy by ring closure):
在一个指定的结构中,将开链化合物环合在已有的环系基础上,产生另一个环状体系,得到指定构象的刚性化合物,是寻找生物活性构象的有效方法。
3.其他模拟方法(other analogies):
用于避开专利保护,得到新的me-too产物。
开环模拟:
(1)潜在环系
开链化合物可能经代谢酶的氧化或脱水作用关环,在体内转换为有活性的环状衍生物,那么开链化合物是一个潜在的环状化合物,其实质上是前药。
模拟法·开环模拟·潜在环系
氯胍
环氯胍
代谢
(在肾脏中的排出速率太快)
开环模拟:
(2)假环状物
不可逆开链化合物在体内并不环合,但是它的构象与环状活性分子的构象具有一定的相似性。
a,雌二醇的开环类似物:
雌二醇
双脱氢道益酸
阿仑雌酚
己烯雌酚
模拟法·开环模拟·假环状物
关于芳香开环类似物的报道很少。设计假环化合物模拟母体化合物的芳香性和平面性具有一定的难度,这限制了其在药物设计中的应用。例如:
双芳基萘酚
水杨醛肟
蒽醛肟
模拟法·开环模拟·假环状物
模拟法·开环模拟·假环状物
b,克罗卡林(Cromakalim):
克罗卡林的开环类似物,采用柔性大的开链化合物替代吡咯啉酮,所得化合物的活性是克罗卡林的1/3
Cromakalim
Open-chain analog
Dose mg/Kg,p.o.
0.3
1.0
Maximal decrease in blood pressure(%)
39±4
22±5
关环模拟:
在一个指定的结构中,将开链化合物环合在已有的环系基础上,产生另一个环状体系,得到指定构象的刚性化合物,是寻找生物活性构象的有效方法。
关环模拟可能会引入额外的手性中心,或者环合化合物的构象与开链化合物构象不一致。
模拟法·关环模拟
模拟法·关环模拟
a,舒必利(Sulpiride)侧链:
苯甲酰胺类药物,一些含有二乙基氨基乙基侧链,其他一些含有N-乙基吡咯甲基侧链(如舒必利sulpiride),它可以看做是硫必利的侧链环合类似物。
硫必利
舒必利
瑞莫必利,IC50=1.6μM
构象限制性类似物 IC50=1.6μM
模拟法·关环模拟
b,GABA样激动剂:
从γ-氨基丁酸(GABA)到反式-4-氨基-巴豆酸,再经环合生成四氢吡啶甲酸,最后生成稠环化合物THIP,使得柔性GABA分子最终转化为刚性分子THIP,THIP是代谢稳定的强效GABA激动剂。
GABA
反式-4-氨基-巴豆酸
THIP
四氢吡啶甲酸
c,β-阻断剂的环状类似物:
传统的β-阻断剂具有许多的药理活性,如β-阻断作用、奎尼丁样活性、局部麻醉活性和降血压活性。通过对两个方向的关环,得到具有单一药效的构象限制性衍生物。
模拟法·关环模拟
克罗卡林
降血压活性:
钾离子通道激活剂
传统β-阻断剂
苯并恶唑
强效β阻断作用
d,利莫那班(Rimonabant)类似物:
利莫那班是研究最前沿的一个大麻受体(CB-1)拮抗剂,用于治疗肥胖症。将构象限制引入到四取代的吡唑环中,由于可能产生有利的生物活性构象,从而有可能
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