利用蛋白质同源性搜索检验细菌预测基因的起始位点-食品与生物技术.PDFVIP

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2017-06-30 发布于天津
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利用蛋白质同源性搜索检验细菌预测基因的起始位点-食品与生物技术.PDF

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利用蛋白质同源性搜索检验细菌预测基因的起始位点-食品与生物技术

利用蛋白质同源性搜索检验细菌预测基因的起始位点，，，１２１２＊１２夏伟，周大为，李炜疆　　（，，；，）江南大学工业生物技术教育部重点实验室江苏无锡江南大学生物工程学院江苏无锡１．２１４１２２２．２１４１２２：、，。摘要细菌基因组中基因密度高结构相对简单基因预测可以达到较高的准确度细菌基因预，测的一个重要问题是难以准确判断基因起始位点目前应用最广的基因组自动注释方法给出的结果中，／，占总数约的基因的起始位点有分歧尚无利用基因结构的统计特征改进起始位点预１５。，。测的有效方法通过蛋白质同源性搜索为推断起始位点提供新的线索对氧化葡萄糖酸杆菌，。Ｇｌｕｃｏｎｏｂａｃｔｅｒｏｘｄａｎｓ６２１Ｈ全基因组的分析表明这种方法可以实质性改善起始位点预测结果　ｙ　：；；关键词基因组注释基因预测同源性搜索中图分类号：文献标志码：文章编号：（）Ｑ７５３Ａ１６７３－１６８９２０１２０８－０８６５－０６　　　ＥｘａｍｉｎｉｎＳｔａｒｔＳｉｔｅｓｏｆＰｒｅｄｉｃｔｅｄＢａｃｔｅｒｉａｌＧｅｎｅｓＴｈｒｏｕｈｇ　　　　　　ｇ　ＰｒｏｔｅｉｎＨｏｍｏｌｏＳｅａｒｃｈ　ｇｙ　，，，１２１２＊１２ＸＩＡＷｅｉ，ＺＨＯＵＤａｗｅｉ，ＬＩＷｅｉｉａｎ　　　－　　－ｊｇ（，，，；１．ＫｅＬａｂｏｒａｔｏｒｏｆＩｎｄｕｓｔｒｉａｌＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏＭｉｎ