第四节有序样品聚类.pptVIP

第十九章 聚类分析 （Clustering Analysis） Content Similarity coefficient Hierarchical clustering analysis Dynamic clustering analysis Ordered sample clustering analysis 判别分析:在已知分为若干个类的前提下，获得判别模型，并用来判定观察对象的归属。 聚类分析:将随机现象归类的统计学方法，在不知道应分多少类合适的情况下，试图借助数理统计的方法用已收集到的资料找出研究对象的适当归类方法。已成为发掘海量基因信息的首选工具。 二者都是研究分类问题的多元统计分析方法。 聚类分析属于探索性统计分析方法，按照分类目的可分为两大类。 例如测量了n个病例（样品）的m个变量（指标），可进行：（1）R型聚类: 又称指标聚类，是指将m个指标归类的方法，其目的是将指标降维从而选择有代表性的指标。（2）Q型聚类: 又称样品聚类，是指将n个样品归类的方法，其目的是找出样品间的共性。 无论是R型聚类或是Q型聚类的关键是如何定义相似性，即如何把相似性数量化。聚类的第一步需要给出两个指标或两个样品间相似性的度量——相似系数（similarity coefficient）的定义。