基于GPU计算的并行PLS算法研究与实现.pdfVIP

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2017-07-01 发布于未知
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基于GPU计算的并行PLS算法研究与实现.pdf

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第31卷第7期分析测试学报 V01．31NO．7 2012年 7月 FENXICESHIXUEBAO(JournalofInstrumentalAnalysis) 771～778 基于 GPU计算的并行 PLS算法研究与实现杨辉华，¨，唐天彪，李灵巧，郭拓，罗国安 (1．桂林电子科技大学电子工程与自动化学院，广西桂林 541004；2．桂林电子科技大学计算机科学与工程学院，广西桂林 541004；3．清华大学分析中心，北京 100084) 摘要：偏最小二乘算法(PLS)是与红外、近红外光谱分析结合使用最为广泛的化学计量学算法，然而当前 PLS算法通常采用单线程方式实现，当校正模型数量多或样本数量大、波长点数和主成分数较多，模型需对光谱预处理和波长选择方法反复优化时，计算十分缓慢。为大幅提高建模速度，该文提出了一种基于图形处理器(GPU)的并行计算策略，利用具有大规模并行计算特性的GPU作为计算设备，结合CUBLAS库函数实现了基于GPU并行的PLS建模算法(CUPLS)。利用近红外光谱数据集进行性能对比实验，结果表明CUPLS 建模算法较传统单线程实现的PLS算法，加速比可达近42倍，极大地提升了化学计量学算法的建模效率。该方法亦可用于其它化学汁量学算法的加速。关键词：偏最小二乘；并行计算；图形处理器；CUDA；光谱分析中图分类号：0657．3；TB96 文献标识码：A 文章编号：1004—4957(2012)07—0771—08 doi：10．3969／j．issn．1040 —4957．2012．07．003 ResearchandImplementationofParallelPLS Algorithm BasedonGPU Computing YANGHui-hua’ ，TANG Tian，biao，。 LILing—qiao ，GUO Tuo。 LUO Guo．an ，， SchoolofElectricEngineeringandAutomation，GuilinUniversityofElectronicTechnology，Guilin 541004 China；， 2． SchoolofComputerScienceandEngineering，GuilinUniversityofElectronicTechnology，Guilin 541040 ，China； 3．AnalysisCenter，TsinghuaUniversity，Beijing 100084，China) Abstract：Partialleastsquares(PLS)algorithm isoneofthemostcommonusedchemometricalgo— rithms，andisoften combinedwith infraredandnearinfrared spectroscopyanalysis． However its ， regularimplementationinasingle·threadedwaymakesthemodelingprocessseverelyineffec