CH9 核酸生物合成改概要1
聚合反应的特点 DNA 新链生成需引物和模板 DNA复制是模板依赖性的,必须要以亲代DNA链作为模板。亲代DNA的两股链解开后,可分别作为模板进行复制。 新链的延长只可沿5? → 3?方向进行: (模板方向为 3 ? → 5 ? ,合成方向为5? → 3? 。) 端粒及端粒酶的意义: 端粒的长短及端粒酶活性变化与细胞水平的老化(aging)及肿瘤的发生有一定关系。 真核生物启动子 启动子复杂,真核TATA序列的位置不像原核-35那样典型,某些真核生物基因也可以没有TATA序列,而由起动序列参与基本转录的开始。 顺式作用元件:真核生物中转录起始中起转录调控作用的DNA序列 -35区 (TATA盒) -70~-110区 CAAT盒;GC盒 帽子的类型 cap 0( m7G5‘ppp5’N ): 在末端鸟苷的第7位上存在单个甲基化位点的称0型帽子;普遍存在! cap 1 ( m7G5‘ppp5’Nm ): 在次末端核苷酸的核糖上的2′-O位点上还有一个甲基位点的称1型帽子;普遍存在! cap 2 ( m7G5‘ppp5’NmNm ): 在第三个核苷酸的核糖上2′-O有甲基化位点的称2型帽子。很少存在! “原核的tRNA和rRNA的加工”证据 在翻译过程中,参与蛋白质合成的tRNA和rRNA都不是最初的转录产物,这是由于: 它们的5′端都是单磷酸,而原始的转录产物5′应是三磷酸; 分子比初始转录物小; tRNA含有特殊的碱基,这些碱基只有通过一些化学修饰才可以得到。 原核的tRNA初始转录本多为多顺反子(polycistron),也就是几个tRNA分子串连在一起。 串联的tRNA分子都是相同的,如tRNATyr-tRNATyr; 串联的tRNA分子是不同的,如tRNAIle-tRNAAla-tRNAThr; 由tRNA和rRNA串联组成。 少数的tRNA前体为单顺反子(monocistron) “斩头”,形成5′末端;RNaseP内切酶 去尾,形成3’-OH末端; RNaseF,RNaseD 缺-CCA的tRNA要用tRNA核苷酰转移酶加-CCA。 修饰:通过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等进行修饰,如氨基酸臂的4-硫尿苷(4tu), D臂的2甲基鸟苷(2mG),TψC臂的假尿苷(ψ)和反密码子环上的2异戊腺苷(2ipA) 真核tRNA的基因和原核不同: (1)真核的前体分子tRNA是单顺反子,但成簇排列,基因间有间隔区; (2)真核tRNA基因一般都比原核tRNA基因多得多,如酵母约有400个tRNA基因; (3) 5′端单磷酸核苷酸,表明已被加工过; (4) tRNA的前体分子中含有内含子。 真核tRNA的加工和原核的异同: 真核tRNA前体中无二聚体和多聚体;??? 增加了剪接内含子的过程; 都要加CCA。 在E.coli中rRNA有7个转录单位. rRNA序列是保守的,每个转录单位都含有等比例的16S、23S、5S RNA及一个或几个tRNA。 每个转录单位转录成单个的RNA前体分子,经剪切后变成为成熟的RNA的分子。 rRNA前体的加工是由RNase Ⅲ负责的。 真核生物的18S、5.8S和28S rRNA基因是串联在一起形成一个转录本,初始转录本为45S前体,5S RNA是和它们分开转录的,这和原核的rRNA基因不同。 在真核的rRNA加工中rRNA和其他的真核基因也不同,它没有内含子,因此加工时,无需剪切内含子这一步。(例外:四膜虫rRNA加工) Given a DNA sequence, primer adopts the following naming conventions: 原核生物中tRNA前体的加工 原核生物中tRNA前体的加工 问题与思考 原核生物tRNA前体的加工过程?形成成熟tRNA的二级结构特点与对应功能? 切除5‘端与3’端多余的序列,有的3‘端添加CCA,碱基修饰、核糖修饰等; 四环四臂的三叶草结构:氨基酸接受臂, 反密码环及对应臂,T?C-环及对应臂,D(二氢尿嘧啶)-环及对应臂,额外环; 氨基酸接受臂5‘-CCA-3’ :专一性的氨基酸携带位点;反密码环:识别密码子;T?C-环:核糖体附着位点;D(二氢尿嘧啶)-环:专一性的氨酰-tRNA合成酶识别位点。 真核生物中tRNA前体的加工 切除两端;添加ACC与修饰;剪接 真核生物中tRNA前体的加工 原核生物中rRNA前体的加工 原核生物中rRNA前体的加工 形成前体 甲基化 被切割 再切除 真核生物中rRNA前体的加工 少数生物体内只有RNA分子,以亲代RNA为模板合成RNA的过程称为RNA的复制!。复制一般分为两步进行,
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