r语言在遗传统计学中的应用 - 统计之都 (capital of .pptVIP

遗传与疾病 人类的某些性状及部分疾病与人体的遗传因素密切相关 阐明遗传因素与人体疾病或健康状态的关系有非常重要的意义 遗传统计学在这其中起着至关重要的作用 遗传与疾病 疾病的易感基因研究 研究的特点 收集的数据即包含一般的表型数据也包含基因型数据 数据分析时需要用到不同的遗传模型 需要一些遗传统计特有的分析方法：LD的计算，家系图的绘制等 R在遗传统计中的应用 数据整理 获取位点的基本信息 Hardy-Weinberg平衡检验 连锁不平衡的计算 关联研究常用分析方法 家系图的绘制 …… 数据整理 R中的genetics包专门为基因型数据提供一个新的类 — genotype genotype函数是genetics包里最基本的函数，可以将以下四种形式的初始基因型数据转换成便于分析的带有genotype类的数据 以一个字符分隔的向量 g1 - genotype(c(C-C,C-T,C-C,T-T, C-C,),sep=-) 2. 可以按某一位置分隔的向量 g2 - genotype(c(DD,DI,DD,II,),sep=1) 3. 两个分开的向量 allele1 - c(D,D,D,I,) allele2 - c(D,I,D,I,) g3 - genotype(alle