原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
lncRNA芯片服务--汉恒生物.pdf
LncRNA芯片服务手册
汉恒生物技术服务手册
400 092 0065
目录
1 芯片规格
2 芯片特点
3 lncRNA来源
4 lncRNA研究策略
5 lncRNA芯片数据分析策略
6 lncRNA芯片结果验证
400 092 0065
长链非编码RNA(Long noncoding RNAs，lncRNAs)是
一类长度超过200nt，无或少有蛋白编码能力的RNA转录
本，在大部分真核生物基因组多由RNA聚合酶II转录。
LncRNA的表达具有组织特异性，既参与表观遗传、可变
剪接、入核转运等过程，也能以细胞微结构原件、小RNA
前体等发挥功能，且其转录和功能失调可能参与疾病的
发生。因此，对lncRNA生物学功能及其与疾病关系的深
入研究可为临床提供新的思路和应对策略。
1 芯片规格
芯片名称 物种 格式 非冗余探针统计
hanbio Human 人 4*180K lncRNA 46506条+mRNA
lncRNA 芯片 30656条
2 芯片特点
该款芯片覆盖了众多数据库最新lncRNA，是目前涵盖lncRNA
序列最全面的一款产品，同时也包含美国国家生物技术信息中心
RefSeq 基因数据库中最新mRNA，可在一张芯片上同时对lncRNA
和mRNA进行检测，挖掘二者之间的关联。
该款芯片利用Agilent SurePrint专利技术合成60mer的长寡
核苷酸探针，具有超过五个数量级的检测动态范围和极高的灵敏
度，可同时检测样本中的低表达和高表达转录本。对于每个
lncRNA探针至少重复3次，保证了实验的检测可靠度。
400 092 0065
3 lncRNA来源
1）agilent_ncRNA
/earray/
我们沿用安捷伦SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K
v2 版中的非编码RNA 18015条，该款芯片中的非编码RNA来自博
德研究所。
数据收集时间：2012年7月
2）lncRNAdb
/
该数据库的lncRNA来自发表的文献，我们的芯片收录了该数据库
45条lncRNA序列。
数据收集时间：2012年6月
3）Gencode V13
/
该数据库收录了包括UTR数据在内的人类转录本数据，还加入了
计算机和试验输入及验证数据。我们的芯片收录了该数据库8227
条lncRNA序列。
数据收集时间：2012年8月
4）H-invDB
http://h-invitational.jp/hinv/
该数据库是由日本生物信息研究中心(JBIRC)建立并由它和日本
DNA数据库共同维护的关于人类基因的数据库，我们的芯片收录
了该数据库1984条lncRNA序列。
数据收集时间：2012年5月
5）NONCODE V3
/NONCODERv3/guide.htm
该数据库是中国科学院计算技
文档评论（0）