外显子周期三行为特征的研究.pdfVIP

2005 年第 63 卷 化 学 学 报 Vol. 63, 2005 第 13 期, 1215～1219 ACTA CHIMICA SINICA No. 13, 1215～1219 ·研究论文· 外显子周期三行为特征的研究 田元新a 陈 超b 邹小勇*,a,c 邱建丁b a a 蔡沛祥 莫金垣 (a 中山大学化学与化学工程学院 广州 510275) (b 萍乡高等专科学校化工系 萍乡 337055) c ( 湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室 长沙 410082) 摘要 基因中蛋白质的编码区具有周期三行为这一规律已成为目前基因预测的理论基础, 采用功率谱对外显子的周期 三行为特征进行了研究, 结果表明: 大多数外显子独立存在于基因中时并不具有周期三行为, 而当基因被剪切后外显 子连在一起编码蛋白质的时候才具有周期三行为. 并且这种行为特征与外显子的长度、碱基在密码子三个位置上的分 布以及氨基酸密码子的使用偏好均有密切关系, 同时符合蛋白质翻译次序的外显子也具有对密码子使用的偏好性, 这 一研究结果对于提高基因预测的准确率以及内含子功能的研究具有重要意义. 关键词 功率谱; 外显子; 编码区; 周期性 Study on Period-3 Behavior of Exons TIAN, Yuan-Xina CHEN, Chaob ZOU, Xiao-Yong*,a, c QIU, Jian-Dingb CAI, Pei-Xianga MO, Jin-Yuana a ( School of Chemistry and Chemical Engineering, Sun Yet-Sen University, Guangzhou 510275) (b Department of Chemical Engineering, Pingxiang College, Pingxiang 337055) c ( State Key Laboratory of Chem-Biosensing and Chemometrics, Hunan University, Changsha 410082) Abstract It is well-known that base sequences in the protein-coding regions of DNA molecules exhibit a period-3 behavior, which is the theoretical basis of gene predictio