第12组激活沉默基因以获取新型微生物次级代谢产物的策略.pptVIP

* 通过 染色体中DNA 序列 不改变 DNA 甲基化 组蛋白 修饰 染色体 重塑 非编码 RNA 通过 表观遗传调控策略 3 将相关的染色质构型改变，激活沉默基因的表达 * [17] Henrikson JC,Hoover AR,Joyner PM,Cichewicz RH. A chemical epigenetics approach for engineering the in situ biosynthesis of a cryptic natural product from Aspergillusniger[J]. Organic ＆ Biomolecular Chemistry,2009,7(3):435-438. 组蛋白去乙酰化酶 组蛋白乙酰基转移酶 nygeroneA * 核糖体工程是指程通过对微生物次级代谢产物合成相关基因表达的两个重要元件——核糖体或RNA 聚合酶进行修饰和改造，以抗生素抗性突变为外在特征，向其合成相关基因中引入特定的点突变或缺失突变，核糖体结构的改变引起蛋白合成能力的改变，进而激活沉默基因，影响微生物次级代谢产物的合成。 其操作简单，无需了解遗传背景，易于与其他改良方法联合使用而被广泛引用。 核糖体是蛋白质的合成机器, 也是细胞感知营养水平和对生长速率进行调控的重要位点。在稳定生长期, 与次级代谢产物生物合成相关基因的大量表达取决于此时核糖体的功能。因此核糖体突变( 包括核糖体蛋白和 rRNA) 带来的蛋白合成能力的改变, 对次级代谢产物生物合成的影响必然是十分深刻的。 4 核糖体工程策略 * 5.核糖体工程策略 [24] Xu J, Wang Y, Xie SJ, et al. Streptomyces xiamenensis sp.nov., a novel actinomycete isolated from a mangrove sediment sample[J].International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2009, 59: 472- 476. 夫西地酸抗性突变 链霉素抗性突变 利福平抗性突变 new micreobial metabolites * 激活沉默基因簇有时还需要宿主细胞提供合适的环境因素, 因此对宿主细胞进行遗传修饰改造也是必要的 对一些模式微生物的基因组 DNA 进行规模化删减, 获得适用于合成生物学等研究的、含最小基因组或缩减基因组的宿主细胞。 例如 5 宿主细胞的遗传修饰改造 [27] Chou WK, Fanizza I, Uchiyama T, et al. Genome mining in Streptomyces avermitilis: cloning and characterization of SAV_76, the synthase for a new sesquiterpene, avermitilol [J].J Am Chem Soc, 2010, 132: 8850?8851. * 单菌多次级代谢产物（one strain-many compounds，OSMAC）策略，是通过改变培养培养基成分、通气量及添加重金属和酶抑制剂等发酵条件来获取更多新型的次级代谢产物的方法 缺点：OSMAC策略虽然有效，但是其工作量大，且最终能否获得新的有活性的次级代谢产物并不确定 6 单菌多次级代谢产物策略 [21] Banskota AH,McAlpine JB,Srensen D,et al.Isolation and identification of three new 5-Alkenyl-3,3 (2H) - furanones from two streptomyces species using a genomic screening approach[J].The Journal of Antibiotics,2006,59(3):168-176. * 生物信息学和代谢组学 微生物基因组测序 分离纯化和鉴定技术手段 我们有理由相信， 越来越多的沉默基因将被发掘，我们也将进入通过激活微生物的沉默基因来获得新的生物活性天然产物的黄金时代，并为临床研制更多治愈复杂疾病的新药。 * * 人有了知识，就会具备各种分析能力， 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书，广泛阅读， 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍，我们能丰富知识， 培养逻辑思维能力； 通过阅读文学作品，我们能提高文学鉴赏水平， 培养文学情趣； 通过阅读报刊，我们能增长见识，扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操， 给我们巨大的